RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	ATG21	Q02887	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	BET5	Q03630	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YFH1	Q07540	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	DAD1	Q12248	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YPT10	P38146	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SRP14	P38985	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	MIC27	P50945	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	UBC11	P52492	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	BET2	P20133	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YAR068W	P39564	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SCS3	P53012	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	MCH4	Q08268	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RAD6	P06104	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	HEM4	P06174	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	ECM15	P35195	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YKL070W	P36087	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SFT2	P38166	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	GON7	P46984	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	AQR1	P53943	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	PET191	Q02772	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	GPI19	Q04082	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YJL193W	P39542	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CYB5	P40312	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	DSK2	P48510	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	MIM1	Q08176	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	MSI1	P13712	422 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	QCR9	P22289	66 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	ERV1	P27882	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	RAV2	Q03956	351 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	ECM12	O13529	151 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	SUN4	P53616	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YNR064C	P53750	290 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	MRPL19	P53875	158 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	CDC26	P14724	124 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	FUB1	P25659	250 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	FRM2	P37261	193 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	DSE2	P38844	325 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	ABF2	Q02486	183 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	ENV10	Q99382	181 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	REC104	P33323	182 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YKR041W	P36134	250 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	MST28	P39552	234 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YER181C	P40097	107 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	CUP9	P41817	306 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YFR045W	P43617	309 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	NRG2	P38082	220 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	VHS2	P40463	436 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	CAX4	P53223	239 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	CPD1	P53314	239 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YPS3	Q12303	508 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	GCS1	P35197	352 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	POM34	Q12445	299 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	OPI3	P05375	206 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	RPB8	P20436	146 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	APS1	P35181	156 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YFR020W	P43600	232 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YCR085W	P25650	117 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YGR269W	P40326	108 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	FIT3	Q08907	204 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	RPP1	P38786	293 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	AIM34	Q03673	198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	MSA1	Q08471	629 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YPS1	P32329	569 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
RGT1	YKL038W	LCB3	P47013	409 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YDL186W	P48568	277 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	HNT2	P49775	206 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	TIM10	P87108	93 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	YPL073C	P40323	161 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RGT1	YKL038W	LST8	P41318	303 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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