RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W ATG40Q99325 256 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YOR338WQ99326 363 aa2.88□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TIM9O74700 87 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MAK32P23060 363 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TOM40P23644 387 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPA12P32529 125 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MID2P36027 376 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MRP21P38175 177 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W HSP10P38910 106 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YIL169CP40442 995 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W PHS1P40857 217 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W OST1P41543 476 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W GPI2P46961 280 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TOS2P50078 622 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TAM41P53230 385 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W ALG9P53868 555 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YMR317WQ04893 1140 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YML053CQ04978 212 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RLM1Q12224 676 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YPS3Q12303 508 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W ENV10Q99382 181 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YPL229WQ99395 206 aa2.87□□□□□ -1.95
VFA1YER128W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W DSS4P32601 143 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YAR029WP39549 74 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YND1P40009 630 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SPO73P40031 143 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YFR054CP43622 192 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TIS11P47977 285 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W UBP8P50102 471 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W KNH1P50112 268 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W CPD1P53314 239 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W BUD25P85052 153 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SHH4Q06236 168 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YDL218WQ07629 317 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.86□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YOL162WP0CF19 215 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W URA5P13298 226 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TFS1P14306 219 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YCR050CP25630 102 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPB7P34087 171 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W NRG2P38082 220 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W UMP1P38293 148 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YHR140WP38842 239 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MBB1P39534 108 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W EAF6P47128 113 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MIC27P50945 234 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W HST4P53688 370 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W IRC25Q07951 179 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W ATG41Q12048 136 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SLM3Q12093 417 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W DAD1Q12248 94 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YDL180WQ12301 547 aa2.85□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RPS2P25443 254 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W QRI5P32344 111 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W TOM6P33448 61 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W PAM17P36147 197 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W ECM34P38728 170 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SPL2P38839 148 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SVP26P38869 228 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YER134CP40081 178 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W MPM1P40364 252 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W DSK2P48510 373 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W GPI19Q04082 140 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W RIM9Q04734 239 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W YFL041W-AQ3E817 63 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W KSH1Q8TGJ3 72 aa2.84□□□□□ -1.95
VFA1YER128W SEC11P15367 167 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W SPO13P23624 291 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W SFT2P38166 215 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W GPI18P38211 433 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YBR292CP38357 123 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W FIP1P45976 327 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YJL028WP47062 111 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W BXI1P48558 297 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W SDS23P53172 527 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W ATO3Q12359 275 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W MSB2P32334 1306 aa2.83□□□□□ -1.96
VFA1YER128W MXR2P25566 168 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W INM1P38710 295 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YIL029CP40538 142 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YIA6P40556 373 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W TDA4P47153 279 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YLR281CQ05863 155 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YLR296WQ05898 108 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W HPA2Q06592 156 aa2.82□□□□□ -1.96
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