RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DHRS4Q9BTZ2 278 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 VPS11Q9H270 941 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 LTBP1Q14766 1721 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ETS2P15036 469 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 HIF1AQ16665 826 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PANX3Q96QZ0 392 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 FAM192AQ9GZU8 254 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TM9SF1O15321 606 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31D3P0C874 917 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ANPEPP15144 967 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MCL1Q07820 350 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SPP2Q13103 211 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 KRT72Q14CN4 511 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 GSTA3Q16772 222 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DOK7Q18PE1 504 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TTC17Q96AE7 1141 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 NFASCO94856 1347 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 KRT1P04264 644 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 POLR2MP0CAP2 368 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 ETV4P43268 484 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 RAP1GDS1P52306 607 aa21.52■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 TEKT1Q969V4 418 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 SERAC1Q96JX3 654 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 A8MXQ7 604 aa21.51■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.51■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.51■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.51■■□□□ 1.03
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PMS1-222ENST00000639501 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 LPXNO60711 386 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 GH2P01242 217 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 NCKAP1LP55160 1127 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 UGCGQ16739 394 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-222ENST00000639501 PPCSQ9HAB8 311 aa21.5■■□□□ 1.03
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