RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	CLCA1	A8K7I4	914 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	TOR1B	O14657	336 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	SPDEF	O95238	335 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	ADRB1	P08588	477 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	DGCR2	P98153	550 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	SPSB4	Q96A44	273 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	CHST8	Q9H2A9	424 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	SERHL	Q9NQF3	203 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATRX-223	ENST00000637175	MYO1C	O00159	1063 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CCP110	O43303	1012 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LPXN	O60711	386 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FGF18	O76093	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ITGAL	P20701	1170 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FGFR2	P21802	821 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	GATA3	P23771	443 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LRPAP1	P30533	357 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PTGS2	P35354	604 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NPTX2	P47972	431 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NDUFV1	P49821	464 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LILRA4	P59901	499 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	BIRC2	Q13490	618 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TP53BP2	Q13625	1128 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PMS2P11	Q13670	270 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TUBA3C	Q13748	450 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FAM209B	Q5JX69	171 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	UNC13D	Q70J99	1090 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SPRED1	Q7Z699	444 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MPP5	Q8N3R9	675 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SNX19	Q92543	992 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	IQCD	Q96DY2	449 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	GDF15	Q99988	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MID2	Q9UJV3	735 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NCAN	O14594	1321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175		A0A0B4J269	797 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	UNC119B	A6NIH7	251 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175		B8ZZF3	427 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	APOL1	O14791	398 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	AREL1	O15033	823 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PROM1	O43490	865 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	A1BG	P04217	495 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SRGN	P10124	158 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ACVR2A	P27037	513 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	IL1R2	P27930	398 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	DGKE	P52429	567 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	GUCY1B3	Q02153	619 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FPGS	Q05932	587 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	BTK	Q06187	659 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TUBB3	Q13509	450 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NPY5R	Q15761	445 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PLA1A	Q53H76	456 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FCRL6	Q6DN72	434 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	GPR149	Q86SP6	731 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	YAF2	Q8IY57	180 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SYNE4	Q8N205	404 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LNX2	Q8N448	690 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FANCB	Q8NB91	859 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ASB10	Q8WXI3	467 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		3.76	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms