RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	SPA17	Q15506	151 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	CWH43	Q9H720	699 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CELF4-222	ENST00000601392	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MED7	O43513	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CLSTN1	O94985	981 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC175	P0C221	793 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	VDR	P11473	427 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CDH8	P55286	799 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	KRT17	Q04695	432 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	HYAL1	Q12794	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CNGA2	Q16280	664 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392		A0A087X0T9	212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NRP1	O14786	923 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SYN3	O14994	580 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GALT	P07902	379 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	FAM228B	P0C875	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ODC1	P11926	461 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CD58	P19256	250 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GNA15	P30679	374 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	IRS1	P35568	1242 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PBX3	P40426	434 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NRIP1	P48552	1158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NDUFV1	P49821	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NDST1	P52848	882 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CAMK1	Q14012	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MTF1	Q14872	753 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392		A8MXQ7	604 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	EFEMP2	O95967	443 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TUBB4A	P04350	444 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CHRNB2	P17787	502 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CA8	P35219	290 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MAGEA1	P43355	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	OR1G1	P47890	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	BCAR1	P56945	870 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	FMO1	Q01740	532 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CLUL1	Q15846	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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