RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.58■■□□□ 1.69
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNIP3Q96KP6 325 aa25.58■■□□□ 1.69
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.58■■□□□ 1.69
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRRG1O14668 218 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNMA1Q12791 1236 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC142Q17RM4 750 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UVSSAQ2YD98 709 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RRAGAQ7L523 313 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBR7Q8N806 425 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KAT5Q92993 513 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CD207Q9UJ71 328 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.57■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C4orf50Q6ZRC1 276 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WHAMMQ8TF30 809 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYLPFQ96A32 169 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM81BQ96LP2 452 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TWNKQ96RR1 684 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRISPLD1Q9H336 500 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIX2Q9NPC8 291 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 THEGQ9P2T0 379 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 INSL5Q9Y5Q6 135 aa25.56■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL6A3P12111 3177 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RFPL2O75678 378 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HOXA9P31269 272 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APBA1Q02410 837 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DUSP4Q13115 394 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ORC1Q13415 861 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLUL1Q15846 466 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACOT1Q86TX2 421 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCB6Q9NP58 842 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 YIPF1Q9Y548 306 aa25.55■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAPLNO95428 1278 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDR1P51861 262 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBXN1Q04323 297 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LEXMQ3ZCV2 418 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GJB7Q6PEY0 223 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCED1BQ96HM7 432 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APOL5Q9BWW9 433 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 S1PR5Q9H228 398 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.54■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SERPINC1P01008 464 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRG1P02750 347 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACO1P21399 889 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFAP3P55082 362 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP27A1Q02318 531 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITIH3Q06033 890 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF394Q53GI3 561 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF214Q8ND24 703 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POU2F2P09086 479 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TUFMP49411 452 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAD23BP54727 409 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FANCCQ00597 558 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TFF2Q03403 129 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLD1Q13393 1074 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CES5AQ6NT32 575 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.52■■□□□ 1.68
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC4A11Q8NBS3 891 aa25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms