RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 FMO2Q99518 471 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 POLIQ9UNA4 740 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PLAAQ9Y263 795 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP83Q9Y592 693 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 M0QZ92 97 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PSTPIP1O43586 416 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 RECQL4O94761 1208 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 THPOP40225 353 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL8AQ96BM9 186 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 APOL6Q9BWW8 343 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC19Q9H756 370 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS6KA5O75582 802 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MAN1A1P33908 653 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 FLT3P36888 993 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB6Q15916 424 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TTMPQ5BVD1 217 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TMC3Q7Z5M5 1100 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF12Q96FN5 646 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP2Q9UGN5 583 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQY0 241 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SGO2Q562F6 1265 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 BCO2Q9BYV7 579 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 DPP3Q9NY33 737 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX24Q9Y343 169 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 IPPQ9Y573 584 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PTK7Q13308 1070 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TFAP2BQ92481 460 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMYND15Q9H091 742 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 KLK14Q9P0G3 267 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MED7O43513 233 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ATICP31939 592 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTN3Q9P232 1028 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PLTPP55058 493 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TAP1Q03518 808 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MTFR1Q15390 333 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ERICH1Q86X53 443 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SDCBP2Q9H190 292 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PPEF2O14830 753 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PPFIA2O75334 1257 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ECEL1O95672 775 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PAEPP09466 180 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTN2P35609 894 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 RAP1GAPP47736 663 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 XKR4Q5GH76 650 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SLCO2A1Q92959 643 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 USTQ9Y2C2 406 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 DERAQ9Y315 318 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 H0YGN5 161 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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