RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SYT15Q9BQS2 421 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SNX25Q9H3E2 840 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GDE1Q9NZC3 331 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CDH9Q9ULB4 789 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DUSP12Q9UNI6 340 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 NME7Q9Y5B8 376 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 BIN1O00499 593 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 BMP6P22004 513 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP2F1P24903 491 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GCLMP48507 274 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ENPEPQ07075 957 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM171BQ6P995 826 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MTSS1LQ765P7 747 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ITIH5Q86UX2 942 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 OR6B3Q8NGW1 331 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR152Q8TDT2 470 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GIPC2Q8TF65 315 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPRDP23468 1912 aa18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PSMA7O14818 248 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 HLA-DRAP01903 254 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM163BP0C2L3 166 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 EPB41P11171 864 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 COL9A1P20849 921 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CCNE1P24864 410 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PIK3CAP42336 1068 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR15P49685 360 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CDH8P55286 799 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC63Q05C16 580 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP3CAQ08209 521 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MORC3Q14149 939 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 VEPH1Q14D04 833 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CAMK4Q16566 473 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 KXD1Q9BQD3 176 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCB6Q9NP58 842 aa18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DENND4CQ5VZ89 1909 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1W2PRU2 124 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ASS1P00966 412 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 RAP1GAPP47736 663 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TEAD2Q15562 447 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TAF12Q16514 161 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TAF4BQ92750 862 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MYLPFQ96A32 169 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 96.1
KCNQ1-205ENST00000496887 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 OBSL1O75147 1896 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 A8MXQ7 604 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CFHP08603 1231 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SRFP11831 508 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GABRR2P28476 465 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GTF2H1P32780 548 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP1R2P41236 205 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP27A1Q02318 531 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DDR2Q16832 855 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MDH1BQ5I0G3 518 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GAREM2Q75VX8 874 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 STKLD1Q8NE28 680 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SDCBP2Q9H190 292 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GREB1Q4ZG55 1949 aa18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FGF19O95750 216 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 P4HA1P13674 534 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms