RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A ERV41Q04651 352 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A ARV1Q06541 321 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YMR030W-AQ3E760 96 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A KTI11Q3E840 82 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A POR1P04840 283 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RPB7P34087 171 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YAP3P38749 330 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YHR140WP38842 239 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RRN5Q02983 363 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A TCP1P12612 559 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A MGT1P26188 188 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YEL028WP39989 153 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A ICS3P47034 131 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A DGA1Q08650 418 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YML100W-AQ8TGT0 57 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A COS2P0CX12 379 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A COS3P0CX13 379 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RPL24BP24000 155 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A SUA7P29055 345 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YER134CP40081 178 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A LIA1P47120 325 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A AIM25P47140 327 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A DOC1P53068 250 aa-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A NMA1Q06178 401 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YJL197C-AP0C5P0 93 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A PRP18P33411 251 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A GOS1P38736 223 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A GAT4P40569 121 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A ERG10P41338 398 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A GCD14P46959 383 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A KAP95Q06142 861 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A FSF1Q12029 327 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YOR342CQ12182 319 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A SNF8Q12483 233 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A SNF4P12904 322 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A MTW1P39731 289 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A HPA3P39979 161 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A CMC4Q3E7A9 73 aa-0.75□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YLR255CO13574 117 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A KIN28P06242 306 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YLR157W-EP0CF00 54 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A NHP6BP11633 99 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A MEK1P24719 497 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YBR016WP38216 128 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YEL008WP40001 126 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A HMF1P40037 129 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A APA2P22108 325 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A TRX3P25372 127 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A DYN3Q04949 312 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A LOA1Q06508 300 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A PAM18Q07914 168 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A PSF1Q12488 208 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YDR524C-BQ3E6R4 66 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YDR157WA0A023PZE8 133 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A GCN3P14741 305 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YNL046WP53956 172 aa-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YNL010WP53981 241 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A MGR3Q04472 501 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A KEI1Q06346 221 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YMR252CQ04814 134 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A PRP8P33334 2413 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A PEX34P25584 144 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YJR149WP47177 404 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RAD17P48581 401 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YGR164WP53291 111 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YDC1Q02896 317 aa-0.77□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A KRR1P25586 316 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A SPS18P32572 300 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A CAF4P36130 643 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YKR070WP36151 352 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A PDX3P38075 228 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A CWC21Q03375 135 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YDR391CQ04170 232 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A HUT1Q12520 339 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YOR034C-AQ3E735 80 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A PHO85P17157 305 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A MAG1P22134 296 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A FAR7P43592 221 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A APS3P47064 194 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A MMS2P53152 137 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YHR050W-AQ05451 56 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YNG1Q08465 219 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A IGO2Q9P305 131 aa-0.78□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A CDC39P25655 2108 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A RAD6P06104 172 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A LDB7P38210 180 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MIC12P38341 106 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A OTU1P43558 301 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A FMN1Q03778 218 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A AUA1P32450 94 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A BMH2P34730 273 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.79□□□□□ -2.54not detected
YPL060C-AYPL060C-A NSG1P38837 291 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A IPT1P38954 527 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A PAM16P42949 149 aa-0.79□□□□□ -2.54
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