RNA–Protein interactions for RNA: YNL321W

VNX1, Transcript of Calcium/H+ antiporter localized to the endoplasmic reticulum membrane, yeast

Gene VNX1, Length 2,727 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VNX1	YNL321W	HSK3	P69852	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	TSA2	Q04120	196 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	LIP2	Q06005	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YHL037C	P38733	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	PDR17	P53844	350 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ARL3	Q02804	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	MAK32	P23060	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	GLC8	P41818	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	TMA23	Q03525	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	AIM34	Q03673	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	API2	Q04413	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	LAS17	Q12446	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	HFA1	P32874	2273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	LSB5	P25369	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ZRT1	P32804	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	RIM9	Q04734	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	UBC13	P52490	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	CTR3	Q06686	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	COA2	Q3E823	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	PGD1	P40356	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	XPT1	P47165	209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	KEG1	P43614	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	CAF40	P53829	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	FYV7	Q12247	151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ROX3	P25046	220 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	RFC2	P40348	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	GMC1	Q04399	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	PRR2	Q12310	699 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	MRS1	P07266	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	PHD1	P36093	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YBR220C	P38318	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	GON7	P46984	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	YOP1	Q12402	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	COQ3	P27680	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	HCH1	P53834	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	SEC59	P20048	519 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	GEP7	P53171	287 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ADD37	Q03233	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	LPP1	Q04396	274 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VNX1	YNL321W	ECM14	P38836	430 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YFL051C	P43552	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YGL260W	P53056	76 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YNL046W	P53956	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	CRZ1	P53968	678 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YPS3	Q12303	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YCR025C	P25352	136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YFL015C	P43578	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	TTI2	P47168	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YGR050C	P53231	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YGR151C	P53287	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	ATG5	Q12380	294 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	QCR9	P22289	66 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	MRS4	P23500	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	FSH2	Q05015	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	AHT1	P29589	182 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	GTT1	P40582	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	RFM1	Q12192	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	TRS20	P38334	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	PHS1	P40857	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VNX1	YNL321W	PAU4	P53427	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.8 ms