RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	YGL010W	P25338	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	UGX2	P32772	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	TKL2	P33315	681 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SDS24	P38314	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU13	P38725	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YNL198C	P40166	100 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PRM5	P40476	318 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU10	Q03050	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	TSA2	Q04120	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU20	Q08322	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	HNT3	Q08702	217 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	FCY22	Q12119	530 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MAK32	P23060	363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	XPT1	P47165	209 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	INO4	P13902	151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	TRX3	P25372	127 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YCR100C	P25606	316 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	TIR2	P33890	251 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PHD1	P36093	366 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YHR130C	P38834	111 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YEL073C	P39974	107 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MOB1	P40484	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YJL028W	P47062	111 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	COQ5	P49017	307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	BRR6	P53062	197 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YGL230C	P53074	147 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	DAD3	P69850	94 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	HPF1	Q05164	967 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	GEP5	Q12393	293 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MRS4	P23500	304 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SPS18	P32572	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YIL169C	P40442	995 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	BXI1	P48558	297 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YNR048W	P53740	393 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YLR152C	P54072	576 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YCR023C	P25351	611 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
UBX2	YML013W	CSE2	P33308	149 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SGE1	P33335	543 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	TEM1	P38987	245 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	DFG10	P40526	253 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	HAC1	P41546	238 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SNO3	P43544	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	UBC13	P52490	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	ABF2	Q02486	183 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SCO1	P23833	295 aa		4.65	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	DOG2	P38773	246 aa		4.65	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YND1	P40009	630 aa		4.65	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	CAB4	P53332	305 aa		4.65	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.65	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	CUP2	P15315	225 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SEC11	P15367	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	GLN3	P18494	730 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SPO13	P23624	291 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	PCL5	P38794	229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	CDC43	P18898	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	RNQ1	P25367	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	NAT3	Q06504	195 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	PFA4	Q12006	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	MCP1	Q12106	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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