RNA–Protein interactions for RNA: YLR250W

SSP120, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SSP120, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP120	YLR250W	ECM25	P32525	599 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	GPG1	P53130	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	HST4	P53688	370 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	PDR17	P53844	350 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	IZH3	Q07959	543 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	MRP10	O75012	95 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	ERS1	P17261	260 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	MRPL3	P36516	390 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	VMA22	P38784	181 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YGR269W	P40326	108 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	GAT4	P40569	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	AIM24	P47127	394 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	ODC1	Q03028	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	ARR3	Q06598	404 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	PUT1	P09368	476 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	RPR2	P40571	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	GPI15	P53961	229 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	SDH7	Q04401	133 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	ARG80	P07249	177 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	FPR2	P32472	135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	PHD1	P36093	366 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	SFT2	P38166	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YBR242W	P38331	238 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	PTC7	P38797	343 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YIL077C	P40508	320 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	UBC7	Q02159	165 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	IZH1	Q03419	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	SHH3	Q04487	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSP120	YLR250W	ZRC1	P20107	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	TIR2	P33890	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YPC1	P38298	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	SLM6	P38343	150 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YEA6	P39953	335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	MIC27	P50945	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	PKP2	P53170	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	BOR1	P53838	576 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	SGF11	Q03067	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	CTR3	Q06686	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	PRR2	Q12310	699 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	GCN3	P14741	305 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	PET100	P38958	111 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	SWM2	P40342	146 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	VAM10	Q08474	114 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	HUA1	P40325	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	SNX4	P47057	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	TIM44	Q01852	431 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	LOA1	Q06508	300 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	CYC7	P00045	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	AFR1	P33304	620 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YHR022C	P38763	256 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	MCM22	P47167	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	ERV2	Q12284	196 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YBL059W	P34224	193 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	DER1	P38307	211 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	ORM1	P53224	222 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YNR071C	P53757	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	CDC50	P25656	391 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	MBB1	P39534	108 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	DID2	P69771	204 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSP120	YLR250W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	VMA16	P23968	213 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	VHS2	P40463	436 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	SAS2	P40963	338 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	DSK2	P48510	373 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	AVO2	Q04749	426 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	CCW12	Q12127	133 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	SCM3	Q12334	223 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	SPO13	P23624	291 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SSP120	YLR250W	YEA4	P40004	342 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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