RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W TTI2P47168 421 aa3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W HHO1P53551 258 aa3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W FMN1Q03778 218 aa3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W YMR320WQ04897 101 aa3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W HRD1Q08109 551 aa3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W PSF1Q12488 208 aa3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W Q0144Q9ZZW2 109 aa3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YKR104WYKR104W REP2P03872 296 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W UTH1P36135 365 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W OPY1P38271 328 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W DSK2P48510 373 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W APJ1P53940 528 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W TSA2Q04120 196 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W SDH7Q04401 133 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W FRQ1Q06389 190 aa3.71□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W TRA1P38811 3744 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RAD10P06838 210 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W SCL1P21243 252 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W PCL1P24867 279 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W CPR5P35176 225 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YER134CP40081 178 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YER188WP40103 239 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RSM10Q03201 203 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W WIP1Q2V2P8 89 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YLR412C-AQ3E742 68 aa3.7□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W ATP15P21306 62 aa3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W TKL2P33315 681 aa3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YFR054CP43622 192 aa3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W TIM8P57744 87 aa3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YDR366CP87287 132 aa3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W AKR2Q12013 749 aa3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W ATP14Q12349 124 aa3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W CPA1P07258 411 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data3.68□□□□□ -1.82not detected
YKR104WYKR104W MID2P36027 376 aa3.68□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.68□□□□□ -1.82not detected
YKR104WYKR104W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YFL019CP43576 117 aa3.68□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W SNX4P47057 423 aa3.68□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W LAA1P39526 2014 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W TIM9O74700 87 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W ATP5P09457 212 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W ECO1P43605 281 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W GON7P46984 123 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W AIF1P52923 378 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YGR039WP53225 103 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W CAB4P53332 305 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W SAS5Q99314 248 aa3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W TIR1P10863 254 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W HSP30P25619 332 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W RPS20P38701 121 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W GLC8P41818 229 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YFL012WP43580 148 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W FIP1P45976 327 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W APS3P47064 194 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YGL193CP53097 103 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W YGR026WP53217 278 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W VPS71Q03433 280 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W CNL1Q06333 122 aa3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
YKR104WYKR104W MRPL17P36528 281 aa3.65□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W GLR1P41921 483 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W YDR274CP87283 123 aa3.65□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W FCY1Q12178 158 aa3.65□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W YOR214CQ12282 236 aa3.65□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W YAR023CD6VPM8 179 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W YKR032WP36127 104 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data3.64□□□□□ -1.83 RIP-Chip
YKR104WYKR104W YFR045WP43617 309 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W YGR219WP53307 113 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W NEJ1Q06148 342 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W NAT3Q06504 195 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W YDL012CQ12489 107 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W YIR021W-AQ3E739 70 aa3.64□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W MAK31P23059 88 aa3.63□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W RSA4P25382 515 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W SRP21P32342 167 aa3.63□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W PTC1P35182 281 aa3.63□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YKR104WYKR104W GPI2P46961 280 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8 ms