RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	SIA1	Q12212	622 aa		0.6	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YCT1	Q12235	531 aa		0.6	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	MED4	Q12343	284 aa		0.6	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	TRM10	Q12400	293 aa		0.6	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.6	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.6	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.6	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	UBC4	P15731	148 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	FAR1	P21268	830 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SPS18	P32572	300 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	UGX2	P32772	223 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	ECT1	P33412	323 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SEC66	P33754	206 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YUH1	P35127	236 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	UMP1	P38293	148 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YAR068W	P39564	161 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YER076C	P40049	302 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RTT105	P40063	208 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	VHS2	P40463	436 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	CIN5	P40917	295 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YCH1	P42937	148 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YFL019C	P43576	117 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	MGA1	P53050	456 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	BUD25	P85052	153 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	BET5	Q03630	159 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	PRR2	Q12310	699 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.59	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	ECM12	O13529	151 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	VPS63	O13549	108 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
PAM16	YJL104W	SPS2	P08459	502 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
PAM16	YJL104W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	MRPL28	P36527	147 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
PAM16	YJL104W	YNL217W	P40152	326 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	AIM20	P40451	204 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	FMC1	P40491	155 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	FAR7	P43592	221 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	OST3	P48439	350 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	FMP48	P53233	369 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	GPI15	P53961	229 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	TLG1	Q03322	224 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	FIN1	Q03898	291 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	SMP3	Q04174	516 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	VBA1	Q04301	562 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	ELP6	Q04868	273 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	DYN3	Q04949	312 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	DPP1	Q05521	289 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	GPI11	Q06636	219 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YOR292C	Q08743	309 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	FIT2	Q08906	153 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	NFI1	Q12216	726 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	IES3	Q12345	250 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YOL085C	Q99345	113 aa		0.58	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YKR045C	P36138	183 aa		0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	RRG9	P40156	214 aa		0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	JLP2	P40206	208 aa		0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	IGD1	P43598	195 aa		0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	BXI1	P48558	297 aa		0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	PRM8	P53174	237 aa		0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YNL033W	P53964	284 aa		0.57	□□□□□ -2.32
PAM16	YJL104W	YNL019C	P53975	284 aa		0.57	□□□□□ -2.32

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 1234.9 ms