RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600676.5

FCHO1-234, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-234ENST00000600676 YARSP54577 528 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 DUPD1Q68J44 220 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 DCUN1D2Q6PH85 259 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 ZIM3Q96PE6 472 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 TJP2Q9UDY2 1190 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 DERAQ9Y315 318 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 COILP38432 576 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 OGDHQ02218 1023 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 INCA1Q0VD86 236 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 GLRA4Q5JXX5 417 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 CCDC50Q8IVM0 306 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 C7orf31Q8N865 590 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 C3orf20Q8ND61 904 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 APOL6Q9BWW8 343 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 RASAL2Q9UJF2 1139 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 PPEF2O14830 753 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 RECQL4O94761 1208 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 MICAL2O94851 1124 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 TCF4P15884 667 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 FLT3P36888 993 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 NDST1P52848 882 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 RNF19AQ9NV58 838 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 STRIP2Q9ULQ0 834 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-234ENST00000600676 AKAP5P24588 427 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 AXLP30530 894 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 HOXC8P31273 242 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 TAP1Q03518 808 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 MYO1EQ12965 1108 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 ZBTB6Q15916 424 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CFAP58Q5T655 872 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 C1orf54Q8WWF1 131 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CPXM1Q96SM3 734 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 SH3GL2Q99962 352 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 F8VP50 259 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 GOLGA8SH3BPF8 625 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 M0QYV0 167 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 KCNJ1P48048 391 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 FNTAP49354 379 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 SGO2Q562F6 1265 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 DPH6Q7L8W6 267 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 IQCKQ8N0W5 287 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 RUFY1Q96T51 708 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 LRRC19Q9H756 370 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CNTN3Q9P232 1028 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CA12O43570 354 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 RALAP11233 206 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 VDRP11473 427 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 GNAT1P11488 350 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 TM4SF4P48230 202 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 TRIB2Q92519 343 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 GABRQQ9UN88 632 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 SNX24Q9Y343 169 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 ERBB2P04626 1255 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CYBAP13498 195 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 PSMC4P43686 418 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 BEST2Q8NFU1 509 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 EXD1Q8NHP7 514 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 ATG4AQ8WYN0 398 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 HEMGNQ9BXL5 484 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 FAM204AQ9H8W3 233 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 KLK14Q9P0G3 267 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 SNX9Q9Y5X1 595 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 PODXLO00592 558 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 HMGCRP04035 888 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 HSD17B3P37058 310 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 FCGRTP55899 365 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 SNX1Q13596 522 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CNGA2Q16280 664 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 GNASQ5JWF2 1037 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 UBXN11Q5T124 520 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 XYLT1Q86Y38 959 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 LRRC45Q96CN5 670 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 SYNCQ9H7C4 482 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 CHST7Q9NS84 486 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-234ENST00000600676 LCMT1Q9UIC8 334 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms