RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 TOM1L1O75674 476 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 LARGE1O95461 756 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 OR52Z1P0C646 297 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CXCL8P10145 99 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ARSAP15289 507 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TYMPP19971 482 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 BFSP1Q12934 665 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ECM1Q16610 540 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 PMS2CLQ68D20 193 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GIPC2Q8TF65 315 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF592Q92610 1267 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CHFRQ96EP1 664 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 DRC1Q96MC2 740 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SLC32A1Q9H598 525 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 IL21Q9HBE4 155 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 PATE3B3GLJ2 98 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 SLC16A4O15374 487 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 CLDN3O15551 220 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ODC1P11926 461 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 CYP3A5P20815 502 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 IRX4P78413 519 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 LMAN2Q12907 356 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 PDGFRLQ15198 375 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF174Q15697 407 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 CPA6Q8N4T0 437 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 PIGKQ92643 395 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 CD101Q93033 1021 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TDP1Q9NUW8 608 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 DNM3Q9UQ16 869 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 CCL26Q9Y258 94 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 IGF2RP11717 2491 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TAF4O00268 1085 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPRM-210ENST00000578916 ATF6P18850 670 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 PAX3P23760 479 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPRM-210ENST00000578916 MCL1Q07820 350 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ZBTB6Q15916 424 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 DAW1Q8N136 415 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 NECAB1Q8N987 351 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 SENP8Q96LD8 212 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 KLK13Q9UKR3 277 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TBX20Q9UMR3 447 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 STK24Q9Y6E0 443 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TRIP11Q15643 1979 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TTC26A0AVF1 554 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 SFI1A8K8P3 1242 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRM-210ENST00000578916 E9PMD0 336 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 PPEF2O14830 753 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRM-210ENST00000578916 BCKDHBP21953 392 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 MAPK8P45983 427 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 IFNAR2P48551 515 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 SMTNP53814 917 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 NLRP12P59046 1061 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 LILRA4P59901 499 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 MTF1Q14872 753 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD1Q15327 319 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TXNDC8Q6A555 127 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ANO7Q6IWH7 933 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 ZPBP2Q6X784 338 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 TTC30AQ86WT1 665 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-210ENST00000578916 METTL23Q86XA0 190 aa9.87□□□□□ -0.83
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