RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 HUS1O60921 280 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TSPY1Q01534 308 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCB1Q12824 385 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 GPR158Q5T848 1215 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 GAREM2Q75VX8 874 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 E2F7Q96AV8 911 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 DPYSL4O14531 572 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ATF6P18850 670 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ME1P48163 572 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 RBP5P82980 135 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ADSSL1Q8N142 457 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 GCNAQ96QF7 691 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 L1RE1Q9UN81 338 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 OBSL1O75147 1896 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 NCANO14594 1321 aa22.55■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF233A6NK53 670 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MAN2B1O00754 1011 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MAGEA9P43362 315 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CYP4F8P98187 520 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.54■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TNNC2P02585 160 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MYL7Q01449 175 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SURF1Q15526 300 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 FAM3CQ92520 227 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CLDN23Q96B33 292 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 INTS13Q9NVM9 706 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SIX4Q9UIU6 781 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 DMDP11532 3685 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 FAM186AA6NE01 2351 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CASP1P29466 404 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CDC25CP30307 473 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 HOXD13P35453 343 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 PKP1Q13835 747 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 UNC13DQ70J99 1090 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 RDH13Q8NBN7 331 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TASP1Q9H6P5 420 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP45Q9UL16 551 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 F5P12259 2224 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 SHISA7A6NL88 538 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CHADO15335 359 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 AFMP43652 599 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 MYO1EQ12965 1108 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 CXorf38Q8TB03 319 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 ACBD6Q9BR61 282 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 IL21Q9HBE4 155 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRJQ12913 1337 aa22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms