RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	BCS1L	Q9Y276	419 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LY75	O60449	1722 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SERTM1	A2A2V5	107 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ALOX15B	O15296	676 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PSTPIP1	O43586	416 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TYROBP	O43914	113 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G6	O60733	806 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBED4	O75132	1171 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NEBL	O76041	1014 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NPTXR	O95502	500 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GAS8	O95995	478 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TPBGL	P0DKB5	382 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FGFR1	P11362	822 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RHOQ	P17081	205 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ITGB5	P18084	799 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RRM1	P23921	792 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	STX2	P32856	288 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN7	P35236	360 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ADCY8	P40145	1251 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGEA4	P43358	317 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NCKAP1L	P55160	1127 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP11A	P98196	1134 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IL9R	Q01113	521 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GHRHR	Q02643	423 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GCNT1	Q02742	428 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SPP2	Q13103	211 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SNX1	Q13596	522 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PDK4	Q16654	411 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C4orf17	Q53FE4	359 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR44	Q5JSH3	913 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ANO7	Q6IWH7	933 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MON1B	Q7L1V2	547 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF276	Q8N554	614 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX9	Q8N6V9	391 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF398	Q8TD17	642 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FBF1	Q8TES7	1133 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM11	Q96F44	468 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM81B	Q96LP2	452 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PLVAP	Q9BX97	442 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TRABD	Q9H4I3	376 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PPCS	Q9HAB8	311 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SAR1A	Q9NR31	198 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFAT	Q9P243	1243 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		5.26	□□□□□ -1.57

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