RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SCOCQ9UIL1 159 aa10.79□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.79□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 LTBP1Q14766 1721 aa10.79□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 DENND3A2RUS2 1198 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SKIP12755 728 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 CACNA2D1P54289 1103 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 NCKAP1LP55160 1127 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 ZBTB16Q05516 673 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 WDR72Q3MJ13 1102 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 EFHC2Q5JST6 749 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 LIN9Q5TKA1 542 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SP8Q8IXZ3 490 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM11Q96F44 468 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 NSL1Q96IY1 281 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 MANSC1Q9H8J5 431 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 C1orf112Q9NSG2 853 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 ARMCX1Q9P291 453 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SLC24A2Q9UI40 661 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SGK1O00141 431 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 DHX15O43143 795 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 AMPD1P23109 780 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 RXRBP28702 533 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 QARSP47897 775 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 ARFIP2P53365 341 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 OCRLQ01968 901 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 PLCB3Q01970 1234 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 GCNT1Q02742 428 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 LMNB2Q03252 620 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 MORF4L2Q15014 288 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 CCNJLQ8IV13 435 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF516Q92618 1163 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 PAFAH2Q99487 392 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 EHMT1Q9H9B1 1298 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 KCNK13Q9HB14 408 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 COL20A1Q9P218 1284 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.78□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1B0GVG6 124 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 NPTX2P47972 431 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 NEK3P51956 506 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 WNT7BP56706 349 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 NOMO3P69849 1222 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 HIF1AQ16665 826 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF398Q8TD17 642 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 BSNDQ8WZ55 320 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 STMN2Q93045 179 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SKA1Q96BD8 255 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 MFSD14AQ96MC6 490 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TSSK1BQ9BXA7 367 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 IDI2Q9BXS1 227 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 SYNCQ9H7C4 482 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 KRT82Q9NSB4 513 aa10.77□□□□□ -0.68
VWA3B-217ENST00000489630 TJP3O95049 919 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 RPS6KA3P51812 740 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 XKR9Q5GH70 373 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 BANPQ8N9N5 519 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 FBXO27Q8NI29 283 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 TMC2Q8TDI7 906 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 MZB1Q8WU39 189 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 FGD4Q96M96 766 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 IWS1Q96ST2 819 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM4Q9C037 500 aa10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 F8VP50 259 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 ATP2A1O14983 1001 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 VCPP55072 806 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 DYNLT1P63172 113 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 CDK16Q00536 496 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 AP1B1Q10567 949 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 FAM182AQ5T1J6 154 aa10.76□□□□□ -0.69
VWA3B-217ENST00000489630 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms