RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 GAREM2Q75VX8 874 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 GCNAQ96QF7 691 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ITGA11Q9UKX5 1188 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 NCANO14594 1321 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 NCAM2O15394 837 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 LAMTOR5O43504 91 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 HUS1O60921 280 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 SP9P0CG40 484 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ATF6P18850 670 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 SMARCB1Q12824 385 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 GPR158Q5T848 1215 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 NELL2Q99435 816 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 FRYLO94915 3013 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ZNF233A6NK53 670 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 DPYSL4O14531 572 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CASP1P29466 404 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 RBP5P82980 135 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CYP4F8P98187 520 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PKP1Q13835 747 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ADSSL1Q8N142 457 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 E2F7Q96AV8 911 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 HSPBP1Q9NZL4 362 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 L1RE1Q9UN81 338 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PIAS3Q9Y6X2 628 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 F5P12259 2224 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PATJQ8NI35 1801 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MAN2B1O00754 1011 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 TNNC2P02585 160 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MYL7Q01449 175 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 RDH13Q8NBN7 331 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CDC25CP30307 473 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MAGEA9P43362 315 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 AFMP43652 599 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 FAM3CQ92520 227 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 SIX4Q9UIU6 781 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CFAP45Q9UL16 551 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 PTPRJQ12913 1337 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 HOXD13P35453 343 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MYO1EQ12965 1108 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 SURF1Q15526 300 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 UNC13DQ70J99 1090 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 STKLD1Q8NE28 680 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CXorf38Q8TB03 319 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ACBD6Q9BR61 282 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 INTS13Q9NVM9 706 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 COL4A2P08572 1712 aa23.39■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 CLIC2O15247 247 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 GPR15P49685 360 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CYP2J2P51589 502 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms