RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GYS1P13807 737 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 OR1G1P47890 313 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SLC29A2Q14542 456 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 INPP5AQ14642 412 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TMX2Q9Y320 296 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MYL2P10916 166 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 COG4Q9H9E3 785 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL2O95198 593 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 AKT1P31749 480 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CENPPQ6IPU0 288 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CHSY1Q86X52 802 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GGT7Q9UJ14 662 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT3HO75486 399 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 EPHB2P29323 1055 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RGS4P49798 205 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 BACE1P56817 501 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK7Q13164 816 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TMED1Q13445 227 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 IPMKQ8NFU5 416 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MUC3BQ9H195 1237 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GIT2Q14161 759 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RFX8Q6ZV50 586 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD7Q92527 254 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 DACH2Q96NX9 599 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PSTPIP1O43586 416 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ASMTLO95671 621 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GZMAP12544 262 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2H3Q13889 308 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PCSK7Q16549 785 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 AURKCQ9UQB9 309 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ARP10275 920 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NPTX2P47972 431 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ERP27Q96DN0 273 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP99D6REC4 459 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MMP14P50281 582 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-24P63145 666 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 DPP3Q9NY33 737 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PTK6Q13882 451 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 OLFM3Q96PB7 478 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 UPP2O95045 317 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TWF1Q12792 350 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 DIP2AQ14689 1571 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PRLRP16471 622 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SYTL3Q4VX76 610 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ERO1BQ86YB8 467 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TMC2Q8TDI7 906 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A3P11169 496 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF7Q14155 803 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00523Q86TU6 105 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CMTM5Q96DZ9 223 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MYBPC2Q14324 1141 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms