RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361439.8

NSMCE1-201, Transcript of NSE1 homolog, SMC5-SMC6 complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NSMCE1, Length 1,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1-201ENST00000361439 ATF2P15336 505 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC9A1P19634 815 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 NRIP1P48552 1158 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 MFAP3P55082 362 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 UBASH3AP57075 661 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ROR1Q01973 937 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 KCNMA1Q12791 1236 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 KCNC3Q14003 757 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 NR1I3Q14994 352 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 FAM171BQ6P995 826 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ABCB6Q9NP58 842 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CISHQ9NSE2 258 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.76□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CBFA2T2O43439 604 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CPB1P15086 417 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 LMO2P25791 158 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CDH8P55286 799 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 HYAL1Q12794 435 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 LRMPQ12912 555 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 OSTM1Q86WC4 334 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 UBR7Q8N806 425 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 RNF214Q8ND24 703 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CASP10Q92851 521 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 IQCDQ96DY2 449 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SYT15Q9BQS2 421 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SDCBP2Q9H190 292 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 MYO7AQ13402 2215 aa14.75□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 TSC2P49815 1807 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 WDR27A2RRH5 827 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ADAM12O43184 909 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 TGM5O43548 720 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PAPLNO95428 1278 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 UCHL3P15374 230 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 NDST1P52848 882 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ADAM15Q13444 863 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SARM1Q6SZW1 724 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PKMYT1Q99640 499 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SIX2Q9NPC8 291 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 402.4
NSMCE1-201ENST00000361439 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.74□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PER2O15055 1255 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CSPG5O95196 566 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 POU2F2P09086 479 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PAEPP09466 180 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 HOXA9P31269 272 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ELF1P32519 619 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 RAP1GAPP47736 663 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SYCP1Q15431 976 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 RRAGAQ7L523 313 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 WHAMMQ8TF30 809 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 ARID3AQ99856 593 aa14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NSMCE1-201ENST00000361439 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.4 ms