RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 PGM1P36871 562 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ARSEP51690 589 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 TAS2R40P59535 323 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ACTR3P61158 418 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 LSAMPQ13449 338 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 LRRC38Q5VT99 294 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PCGF5Q86SE9 256 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 FBXL18Q96ME1 805 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 NDNQ99608 321 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ECSITQ9BQ95 431 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CENPKQ9BS16 269 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 MIS12Q9H081 205 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 RAB20Q9NX57 234 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 TMCO1Q9UM00 188 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PHF24Q9UPV7 400 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.86□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CLUHO75153 1309 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GVG6 124 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 E7ESA3 106 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CHMP2AO43633 222 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 APBA3O96018 575 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ANPEPP15144 967 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PIK3CAP42336 1068 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 BPIFB4P59827 614 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 USH1GQ495M9 461 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CRY2Q49AN0 593 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CEP55Q53EZ4 464 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CCDC110Q8TBZ0 833 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 RIT2Q99578 217 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CNTN3Q9P232 1028 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 DENND3A2RUS2 1198 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 FCHO1O14526 889 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CREB3O43889 395 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 TM7SF2O76062 418 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 AMPD1P23109 780 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 NEK3P51956 506 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 NCKAP1LP55160 1127 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 AP2B1P63010 937 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB16Q05516 673 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 SLC18A2Q05940 514 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 OVGP1Q12889 678 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 GPS1Q13098 491 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 TBCCQ15814 346 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 HIF1AQ16665 826 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 LIN9Q5TKA1 542 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 AAGABQ6PD74 315 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ACAD11Q709F0 780 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 USP37Q86T82 979 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 FNBP1Q96RU3 617 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 PAFAH2Q99487 392 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 C1orf21Q9H246 121 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 ZNF148Q9UQR1 794 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 SCINQ9Y6U3 715 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS3-202ENST00000328514 LTBP1Q14766 1721 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms