RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325942.10

FRAS1-201, Transcript of Fraser extracellular matrix complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FRAS1, Length 7,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAS1-201ENST00000325942 SPG21Q9NZD8 308 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 MID2Q9UJV3 735 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CYP26A1O43174 497 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CYP2F1P24903 491 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ARID5BQ14865 1188 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 INAQ16352 499 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 NEK7Q8TDX7 302 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 AKT1S1Q96B36 256 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 TASP1Q9H6P5 420 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CPDO75976 1380 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ANGPT2O15123 496 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CYP2C8P10632 490 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 MSH3P20585 1137 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CUL3Q13618 768 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 PTPAQ15257 358 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 OGFRQ9NZT2 677 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.97□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 UTYO14607 1347 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 NEDD4P46934 1319 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 RASA4BC9J798 803 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 RASA4O43374 803 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ALAS2P22557 587 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 POU1F1P28069 291 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 POLE2P56282 527 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 DSELQ8IZU8 1212 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 DEFB118Q96PH6 123 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 HMGXB3Q12766 1538 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 GSAPA4D1B5 854 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 LAD1O00515 517 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 RBP5P82980 135 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 PRKCEQ02156 737 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 RCN1Q15293 331 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 USP18Q9UMW8 372 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 CD4P01730 458 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 NPY2RP49146 381 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 POLG2Q9UHN1 485 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.96□□□□□ -0.81
FRAS1-201ENST00000325942 E9PBE3 544 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 CYB561D2O14569 222 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 RPN2P04844 631 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 SFNP31947 248 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 MCAMP43121 646 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 RGS4P49798 205 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 PACS1Q6VY07 963 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 MACC1Q6ZN28 852 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 ALLCQ8N6M5 410 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 RNF112Q9ULX5 631 aa9.96□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 PP2D1A8MPX8 630 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 ITGAXP20702 1163 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 CCT5P48643 541 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 HPS3Q969F9 1004 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 MED15Q96RN5 788 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FRAS1-201ENST00000325942 OR6A2O95222 327 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms