RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 VCXQ9H320 206 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNK13Q9HB14 408 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 HAUS5O94927 633 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PSMG1O95456 288 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GH2P01242 217 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PEX3P56589 373 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SESN3P58005 492 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC34A1Q06495 639 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAF1Q13077 416 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GPS1Q13098 491 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SPP2Q13103 211 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MAMLD1Q13495 774 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GATA6Q92908 595 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PTPRN2Q92932 1015 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 VPS11Q9H270 941 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TBX20Q9UMR3 447 aa8.94□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM150BA6NC51 233 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CAPN9O14815 690 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TM9SF1O15321 606 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP9AO75110 1047 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TJP3O95049 919 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CFHP08603 1231 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GSTA2P09210 222 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SKIP12755 728 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT10P13645 584 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NOMO3P69849 1222 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CYP24A1Q07973 514 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 AP1B1Q10567 949 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 OVGP1Q12889 678 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 RCN2Q14257 317 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT72Q14CN4 511 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CENPUQ71F23 418 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NLRX1Q86UT6 975 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 BANPQ8N9N5 519 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TIPINQ9BVW5 301 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT82Q9NSB4 513 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 HEY2Q9UBP5 337 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CLRN2A0PK11 232 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 DENND3A2RUS2 1198 aa8.93□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CFAP69A5D8W1 941 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms