RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PCSK6P29122 969 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 DLG4P78352 724 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ATP1A4Q13733 1029 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 KIF22Q14807 665 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PSMD6Q15008 389 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 BRINP3Q76B58 766 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM110Q86TL2 294 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 GIPC3Q8TF64 312 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 CPA5Q8WXQ8 436 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 LZICQ8WZA0 190 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 APOL6Q9BWW8 343 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SELENONQ9NZV5 590 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.69□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TISP43B9A030 160 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 H0YIN7 160 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 H3BSA7 217 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ZBTB39O15060 712 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TP73O15350 636 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 MAGEB2O15479 319 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TBC1D12O60347 775 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TOM1L1O75674 476 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 INHBAP08476 426 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ACTR3P61158 418 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 USH1GQ495M9 461 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ANO5Q75V66 913 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 RSPH3Q86UC2 560 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PIK3CDO00329 1044 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SORBS3O60504 671 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 CAMTA2O94983 1202 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 CRABP2P29373 138 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 MAP3K10Q02779 954 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SEPT6Q14141 434 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 OASLQ15646 514 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 OGFOD1Q8N543 542 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ZFP28Q8NHY6 868 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 CSRNP1Q96S65 589 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 USP29Q9HBJ7 922 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PKD2L1Q9P0L9 805 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TRMUO75648 421 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TM7SF2O76062 418 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PROCP04070 461 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PAX3P23760 479 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 IVDP26440 423 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PDE1BQ01064 536 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 BFSP1Q12934 665 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ALCAMQ13740 583 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 LPIN1Q14693 890 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PDSS2Q86YH6 399 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 RNF169Q8NCN4 708 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 NCSTNQ92542 709 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 Q9H521 79 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 S100A14Q9HCY8 104 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa10.68□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 COPEO14579 308 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 CFLARO15519 480 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 E2F6O75461 281 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PHBP35232 272 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 STT3AP46977 705 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 PDK1Q15118 436 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 CYP1B1Q16678 543 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 LRGUKQ96M69 825 aa10.67□□□□□ -0.7
CLDN1-201ENST00000295522 SENP7Q9BQF6 1050 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms