RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DLG4P78352 724 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP8P85298 464 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CYP1B1Q16678 543 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TEKT1Q969V4 418 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 Q9H521 79 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ALS2Q96Q42 1657 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TISP43B9A030 160 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PIK3CDO00329 1044 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB39O15060 712 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TOM1L1O75674 476 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GJA8P48165 433 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SLC12A3P55017 1021 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 APOL6Q9BWW8 343 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NENFQ9UMX5 172 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FSCN2O14926 492 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZMPSTE24O75844 475 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NCKAP1LP55160 1127 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PEX6Q13608 980 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RSPH3Q86UC2 560 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MAF1Q9H063 256 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GMEB1Q9Y692 573 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L10C9JJH3 530 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 COPEO14579 308 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TGFB1I1O43294 461 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CAMTA2O94983 1202 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 IVDP26440 423 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CIITAP33076 1130 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MTTPP55157 894 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ACTR3P61158 418 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PSMD6Q15008 389 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 S100A14Q9HCY8 104 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TM7SF2O76062 418 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CDK4P11802 303 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CRABP2P29373 138 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MAP3K10Q02779 954 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 HIF1AQ16665 826 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GIPC3Q8TF64 312 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 LRGUKQ96M69 825 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TCHPQ9BT92 498 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DUOX1Q9NRD9 1551 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TP73O15350 636 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FKBP6O75344 327 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MXI1P50539 228 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RASA3Q14644 834 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CHI3L2Q15782 390 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SBK1Q52WX2 424 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL35Q6PF15 583 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 H3BSA7 217 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CFLARO15519 480 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D12O60347 775 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PROCP04070 461 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SEPT6Q14141 434 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PDSS2Q86YH6 399 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 HOMEZQ8IX15 550 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NCSTNQ92542 709 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 WWP1Q9H0M0 922 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms