RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNJ18B7U540 433 aa23.27■■□□□ 1.32
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SLC25A39-201ENST00000225308 KCNJ12Q14500 433 aa23.27■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.27■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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SLC25A39-201ENST00000225308 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.27■■□□□ 1.32
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SLC25A39-201ENST00000225308 APOL5Q9BWW9 433 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 CDH22Q9UJ99 828 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.25■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 SNX25Q9H3E2 840 aa23.25■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.25■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.316e-6■□□□□ 8.7
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SLC25A39-201ENST00000225308 NOTCH4Q99466 2003 aa23.23■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 NDST4Q9H3R1 872 aa23.23■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.23■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.23■■□□□ 1.31
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