RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YGR025WP53216 100 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A ARR2Q06597 130 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A GPM2Q12008 311 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A PTC1P35182 281 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YER034WP40022 185 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A FLX1P40464 311 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A FIP1P45976 327 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YLR173WQ06247 608 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YHR214C-EQ8TGK0 99 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A RPO41P13433 1351 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A COX8P04039 78 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YGL041W-AP0C5N3 154 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A EBP2P36049 427 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A RPF1P38805 295 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YAE1P47118 141 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A BXI1P48558 297 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A IRC21Q04772 201 aa-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A PST2Q12335 198 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A RSM25P40496 264 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YFL065CP43539 102 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A PRM8P53174 237 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YOL014WQ08110 124 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A FIT2Q08906 153 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A UBC6P33296 250 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A COX23P38824 151 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YPR014CQ6B0W2 109 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A MYO1P08964 1928 aa-0.68□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A PAN3P36102 679 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A ECM33P38248 429 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YKR005CQ02203 525 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YOR186WQ08560 144 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A MCP1Q12106 302 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A NMT1P14743 455 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YPK2P18961 677 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A OPI1P21957 404 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A CDC10P25342 322 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A EHD3P28817 500 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A MRPL17P36528 281 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A FIG1P38224 298 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YFH7P43591 353 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A TMA23Q03525 211 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YDR278CQ05612 105 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A CDC123Q05791 360 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A CCW12Q12127 133 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A SKS1Q12505 502 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A RPP0P05317 312 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A KSS1P14681 368 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A ROX3P25046 220 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A PAM17P36147 197 aa-0.69□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A GRX2P17695 143 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A POG1P40473 351 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A SWS2P53937 143 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A VPS28Q02767 242 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A COX20Q04935 205 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A GET4Q12125 312 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A CDC28P00546 298 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A AQY2P0CD90 149 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YCR016WP25617 290 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A UBC8P28263 218 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A SWP1Q02795 286 aa-0.7□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A TRM9P49957 279 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YLR460CP54007 376 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A LCL2Q08045 131 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A UIP4Q08926 304 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A COA3Q3E7B2 85 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A MEI4P29467 408 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A AIM4P38305 123 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A ALB1P47019 175 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A SPO19Q03029 223 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A SRL4Q03085 281 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A HNT1Q04344 158 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A URA6P15700 204 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A HYP2P23301 157 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YMR253CQ04835 414 aa-0.71□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A APS1P35181 156 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A NRK1P53915 240 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A ARO80Q04052 950 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A JLP1Q12358 412 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YCR023CP25351 611 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A YMR141CP40211 102 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A TIM13P53299 105 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A UPS1Q05776 175 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A MED4Q12343 284 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A Q0017Q9ZZX8 53 aa-0.72□□□□□ -2.52
YPL060C-AYPL060C-A REP2P03872 296 aa-0.72□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YHL037CP38733 133 aa-0.72□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A SEI1Q06058 285 aa-0.72□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A IRA2P19158 3079 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YBR090CP38253 122 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YDR210WQ03482 75 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A SHH3Q04487 196 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YLR307C-AQ3E825 87 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A YNL194CP40169 301 aa-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A RFC4P40339 323 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
YPL060C-AYPL060C-A SMD3P43321 101 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
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