RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.92	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	YOL024W	Q08172	172 aa		0.92	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	SEN2	P16658	377 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	TRX3	P25372	127 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	AHT1	P29589	182 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	VPS51	P36116	164 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	FMP32	P43557	207 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	PIR1	Q03178	341 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	GRX3	Q03835	250 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	PLP1	Q04004	230 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	LCL2	Q08045	131 aa		0.91	□□□□□ -2.26
BRX1	YOL077C	STF2	P16965	84 aa		0.9	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	UBC8	P28263	218 aa		0.9	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	FMP23	P38231	175 aa		0.9	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	JAC1	P53193	184 aa		0.9	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	ARO80	Q04052	950 aa		0.9	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YOR342C	Q12182	319 aa		0.9	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	CHD1	P32657	1468 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	ADE1	P27616	306 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	NSG1	P38837	291 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	SBH1	P52870	82 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	SBH2	P52871	88 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	NRK1	P53915	240 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	AIM34	Q03673	198 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.89	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YBR242W	P38331	238 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	POG1	P40473	351 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	SHH4	Q06236	168 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	FYV12	Q08559	129 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	DGK1	Q12382	290 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.87	□□□□□ -2.27	not detected
BRX1	YOL077C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	SRP14	P38985	146 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YGL235W	P53071	178 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	TIM13	P53299	105 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	PGA1	P53896	198 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	SNO1	Q03144	224 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	GRX8	Q05926	109 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	PEX11	Q12462	236 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	AHC2	P25649	128 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YHL037C	P38733	133 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	NVJ1	P38881	321 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YFL051C	P43552	160 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	XPT1	P47165	209 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	DAS2	Q12084	232 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	APA2	P22108	325 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	UGX2	P32772	223 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YBL010C	P32788	280 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	VPS28	Q02767	242 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	TLG1	Q03322	224 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	MAK3	Q03503	176 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	GIM5	Q04493	163 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	ATP20	Q12233	115 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	RAD51	P25454	400 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	NUF2	P33895	451 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YKL102C	P34249	101 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	RFC2	P40348	353 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	MPM1	P40364	252 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YIL102C	P40488	101 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YDR476C	Q03362	224 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	GPI17	Q04080	534 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	FIT1	Q04433	528 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	YOR214C	Q12282	236 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BRX1	YOL077C	TRM3	Q07527	1436 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	QCR2	P07257	368 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	HSP30	P25619	332 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	RRT1	P38192	103 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	YAR064W	P39563	99 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	YIP3	P53633	176 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	YNL140C	P53910	189 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	HHT1	P61830	136 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	DML1	Q03652	475 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BRX1	YOL077C	UPS1	Q05776	175 aa		0.83	□□□□□ -2.28

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