RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W TDA4P47153 279 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YGR151CP53287 111 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W NRM1P53718 249 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W BUD25P85052 153 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YDL180WQ12301 547 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PST1Q12355 444 aa3.37□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SWR1Q05471 1514 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YMR316C-AI2HB70 103 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W Q0255P03881 472 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W ATP5P09457 212 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YCR006CP25350 157 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TEM1P38987 245 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PAN6P40459 309 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YIL059CP40520 121 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YJL213WP40896 331 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PFS2P42841 465 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W BAT2P47176 376 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W DAN1P47178 298 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YGL193CP53097 103 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YNL046WP53956 172 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RSM10Q03201 203 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YMR103CQ04436 120 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YOR186WQ08560 144 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YPL264CQ08980 353 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SLM3Q12093 417 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W HTL1Q9URQ5 78 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PEP1P32319 1579 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PDR10P51533 1564 aa3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YRF1-3P0CX14 1859 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YRF1-7P0CX15 1859 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YRF1-6P53819 1859 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TOM40P23644 387 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W CLB6P32943 380 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W SFT2P38166 215 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GGC1P38988 300 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YFR045WP43617 309 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W ARP3P47117 449 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W MRH4P53166 561 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GEP7P53171 287 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W NMA2P53204 395 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TPC1P53257 314 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W ERV29P53337 310 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W RCE1Q03530 315 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W FIT1Q04433 528 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W MSA1Q08471 629 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YPL229WQ99395 206 aa3.35□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W DNA2P38859 1522 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W CPA1P07258 411 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YAR066WP0CX18 203 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YHR214WP0CX19 203 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W PET8P38921 284 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YER181CP40097 107 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GAT4P40569 121 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W YGL088WP53151 121 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GAL83Q04739 417 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W GPI11Q06636 219 aa3.34□□□□□ -1.87
YPT53YNL093W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TY1B-ER2Q03619 1755 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TY1B-MR1Q04214 1755 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TY1B-NL1Q12112 1755 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TY1B-GR1Q12141 1755 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TY1B-BLQ12490 1755 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W MTC6P38849 526 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W HPA3P39979 161 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W PAM16P42949 149 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W EMC4P53073 190 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W YGR050CP53231 118 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W YOR292CQ08743 309 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TIM18Q08749 192 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W USV1Q12132 391 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W NUP170P38181 1502 aa3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W RPB3P16370 318 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W FUN14P18411 198 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W STE4P18851 423 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W AHT1P29589 182 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W YER188WP40103 239 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W TIR3P40552 269 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W PHS1P40857 217 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W FMP41P53889 259 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W YMR082CQ04276 118 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W YPL162CQ12042 273 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W YDL211CQ12121 372 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W NUP159P40477 1460 aa3.32□□□□□ -1.88
YPT53YNL093W HMRA1P0CY11 126 aa3.31□□□□□ -1.88
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