RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	YAP1802	P53309	568 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRN5	YLR141W	POS5	Q06892	414 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRN5	YLR141W	CYC3	P06182	269 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	RRT1	P38192	103 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	BDH1	P39714	382 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YGR018C	P53211	109 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	AGC1	Q12482	902 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YCR022C	P25620	114 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	UTR5	P32630	166 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	UPS2	P35200	230 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	CSH1	P38287	376 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	TAD2	P47058	250 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	PRR2	Q12310	699 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YEA4	P40004	342 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YJR015W	P47090	510 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	COX18	P53239	316 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YLR125W	Q12138	136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	POM34	Q12445	299 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	AVT5	P38176	459 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YGR269W	P40326	108 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	SWM2	P40342	146 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YGL117W	P53133	265 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	NCE103	P53615	221 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	ANT1	Q06497	328 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	RTG1	P32607	177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	LST7	P53237	242 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	ELO2	P25358	347 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YPI1	P43587	155 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	ECM27	P47144	725 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	CAX4	P53223	239 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	TIM18	Q08749	192 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	YPR013C	Q12145	317 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRN5	YLR141W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	BOR1	P53838	576 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	YLR122C	Q12312	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	POP5	P28005	173 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	ARR3	Q06598	404 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	MDM10	P18409	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	POR2	P40478	281 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	BUL1	P48524	976 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	TDA6	Q06466	467 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	YDL242W	Q07746	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	RTS2	P40962	232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	MIC27	P50945	234 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	YHR213W	P0CI67	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	SIP1	P32578	815 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	MRPL50	P53724	139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	SDH7	Q04401	133 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	SHH3	Q04487	196 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	ATG39	Q06159	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	CDC7	P06243	507 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	SRL3	P36167	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	MPC2	P38857	129 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	PEX7	P39108	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	JAC1	P53193	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RRN5	YLR141W	COX2	P00410	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	PTC7	P38797	343 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	CAF16	P43569	289 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	SRB7	P47822	140 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	ODC1	Q03028	310 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	PLP1	Q04004	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.13	□□□□□ -0.63	not detected
RRN5	YLR141W	GLE2	P40066	365 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	YNR066C	P53752	436 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	OCA2	P53949	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	CTR3	Q06686	241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	CDC50	P25656	391 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	YBL059W	P34224	193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	ORM1	P53224	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	HST4	P53688	370 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	AHT1	P29589	182 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	SDH4	P37298	181 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	ATG27	P46989	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	YMR007W	Q03675	126 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	LDS2	Q08218	356 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	AYT1	Q12226	474 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	SPO13	P23624	291 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RRN5	YLR141W	SNF11	P38956	169 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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