RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	YPD1	Q07688	167 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.84	□□□□□ -2.27	not detected
TTI1	YKL033W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SNC2	P33328	115 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AST1	P35183	429 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRPS9	P38120	278 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FCY21	P40039	528 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	COX15	P40086	486 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	BMT5	P40493	336 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FAR7	P43592	221 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RMR1	P53060	241 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	DOC1	P53068	250 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ORT1	Q12375	292 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATG5	Q12380	294 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TRM10	Q12400	293 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PCL9	Q12477	304 aa		0.84	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PAU24	P38155	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	DYN2	Q02647	92 aa		0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PEX30	Q06169	523 aa		0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.84	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CAP2	P13517	287 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RIB7	P33312	244 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RCN1	P36054	211 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YER135C	P40082	130 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	HXT14	P42833	540 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	OCA2	P53949	197 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	COX12	Q01519	83 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	TLG1	Q03322	224 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	LPP1	Q04396	274 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GCN4	P03069	281 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SEN2	P16658	377 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RPB7	P34087	171 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YBR285W	P38354	144 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	AGX1	P43567	385 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VHT1	P53241	593 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PAU12	P53343	120 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MRPS16	Q02608	121 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CTF19	Q02732	369 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	FEX1	Q08913	375 aa		0.83	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.82	□□□□□ -2.28	not detected
TTI1	YKL033W	YIR035C	P40579	254 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	LST8	P41318	303 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	TDA4	P47153	279 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	TOM7	P53507	60 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	EOS1	P53938	366 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YDR286C	Q05530	114 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VAM10	Q08474	114 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YOR292C	Q08743	309 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CDC7	P06243	507 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SUA5	P32579	426 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YUH1	P35127	236 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	UPS2	P35200	230 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YKL075C	P36083	450 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	IRC18	P47056	224 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ALG13	P53178	202 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	IES3	Q12345	250 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	CKA1	P15790	372 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SVP26	P38869	228 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RTT105	P40063	208 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	EFM3	P47163	339 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YGR149W	P48236	432 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	ERV29	P53337	310 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YML018C	Q03730	393 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YMR244W	Q04018	355 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YMR130W	Q04223	302 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VBA1	Q04301	562 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VIK1	Q12045	647 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.82	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	MET17	P06106	444 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	SFK1	P35735	353 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RRF1	P38771	230 aa		0.81	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YHR122W	P38829	231 aa		0.81	□□□□□ -2.28

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