RNA–Protein interactions for RNA: YHR048W

YHK8, Transcript of Presumed antiporter of the major facilitator superfamily, yeastyeast

Gene YHK8, Length 1,545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHK8YHR048W TY1A-MR2P0CX69 440 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W SIP1P32578 815 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W DOG2P38773 246 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W DOG1P38774 246 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W YJL213WP40896 331 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W TY1A-JR2P47099 440 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W MIC27P50945 234 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W BOR1P53838 576 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W TMA23Q03525 211 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W TY1A-DR1Q03856 440 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W SDH7Q04401 133 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W TY1A-BRQ12217 440 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W TY1A-NL2Q12470 440 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W TY1A-GR2Q12485 440 aa5.28□□□□□ -1.56
YHK8YHR048W MSK1P32048 576 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SRB6P32570 121 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W RRT1P38192 103 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W CDS1P38221 457 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YGR269WP40326 108 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SAS2P40963 338 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SPG4Q04438 115 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W TDA6Q06466 467 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W COX19Q3E731 98 aa5.27□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YCR025CP25352 136 aa5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W LDS1P31379 325 aa5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W GPP2P40106 250 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YJR015WP47090 510 aa5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SNN1P48232 102 aa5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W CRH1P53301 507 aa5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W FMP41P53889 259 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W PIS1P06197 220 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SPO13P23624 291 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W INO2P26798 304 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W AHT1P29589 182 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YKR045CP36138 183 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W RIB5P38145 238 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W AVT5P38176 459 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W QDR3P38227 689 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YAR068WP39564 161 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W GNP1P48813 663 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ODC1Q03028 310 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ADD37Q03233 198 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SHH3Q04487 196 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YOR015WQ12169 119 aa5.25□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SOD1P00445 154 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W MRS3P10566 314 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W CSH1P38287 376 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W PTC7P38797 343 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W BDH1P39714 382 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W MOT3P54785 490 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ATC1Q04005 294 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W HOR7Q05827 59 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ARR3Q06598 404 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W POS5Q06892 414 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ATP14Q12349 124 aa5.24□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data5.23□□□□□ -1.57not detected
YHK8YHR048W CDC50P25656 391 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YBL059WP34224 193 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W PAU4P53427 120 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W DUG3P53871 357 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W PRY2P36110 329 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W DER1P38307 211 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W RTS2P40962 232 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W VPS55P47111 140 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W MCM22P47167 239 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YDL186WP48568 277 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W LST7P53237 242 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W CTR3Q06686 241 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W USV1Q12132 391 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W POM34Q12445 299 aa5.23□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SIT1P39980 628 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W CPD1P53314 239 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W CAB4P53332 305 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YNR071CP53757 342 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ISU1Q03020 165 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YMR007WQ03675 126 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W YHP1Q04116 353 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W ORM2Q06144 216 aa5.22□□□□□ -1.57
YHK8YHR048W CDC7P06243 507 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PET494P07390 489 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU1P0CE88 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU14P0CE89 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU6P0CE90 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU18P0CE91 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU8P0CE92 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU11P0CE93 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W SEC59P20048 519 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W HSP12P22943 109 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W ELO2P25358 347 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YCR022CP25620 114 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YPS1P32329 569 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU13P38725 120 aa5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms