RNA–Protein interactions for RNA: YER190W

YRF1-2, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-2, Length 5,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2YER190W RKI1Q12189 258 aa7.34□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SPS18P32572 300 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ANS1P38832 159 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W PHS1P40857 217 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SHH3Q04487 196 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W MIR1P23641 311 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ARO2P28777 376 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W PRE3P38624 215 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W MID1P41821 548 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W MCH4Q08268 501 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W OPI3P05375 206 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W DMA1P38823 416 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ATF1P40353 525 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W TAX4P47030 604 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W STP4Q07351 490 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YLR365WQ7LIF2 110 aa7.33□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W CUP2P15315 225 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W OM14P38325 134 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W BGL2P15703 313 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W HAC1P41546 238 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YOR343CQ12484 108 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W TAD3Q9URQ3 322 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W HTB1P02293 131 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W HTB2P02294 131 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W CIS3P47001 227 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ABF2Q02486 183 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W HMRA1P0CY11 126 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W INO4P13902 151 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W HSP150P32478 413 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YNL195CP40168 261 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data7.32□□□□□ -1.24not detected
YRF1-2YER190W Q0144Q9ZZW2 109 aa7.32□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ZRT1P32804 376 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YIL152WP40455 235 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W LDS2Q08218 356 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ILV5P06168 395 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W DIA1P54005 336 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W COX1P00401 534 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YNL165WP53891 406 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YAP6Q03935 383 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SEI1Q06058 285 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YPR071WQ12346 211 aa7.31□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ARO4P32449 370 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YPT53P36019 220 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W RRT1P38192 103 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W PAU23Q07987 124 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ISU2Q12056 156 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W PAU17Q12370 124 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SET6Q12529 373 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W EST3Q03096 181 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W FPR1P20081 114 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W NNK1P36003 928 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W DAL4Q04895 635 aa7.3□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data7.3□□□□□ -1.24not detected
YRF1-2YER190W BNA2P47125 453 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W DUG3P53871 357 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W OCA2P53949 197 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YPL264CQ08980 353 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W GPI18P38211 433 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W GEP3Q08622 556 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SAS2P40963 338 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W ASM4Q05166 528 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W PHO85P17157 305 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W IMP1P28627 190 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W TIR2P33890 251 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YBR013CP38215 129 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W DUO1P53168 247 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W LST7P53237 242 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W RNH203Q12338 110 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YIL163CP40448 117 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W XBP1P40489 647 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W NOP1P15646 327 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W PAU16P35994 123 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W HED1Q03937 162 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SPC29P33419 253 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W YHL044WP38727 235 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W RPI1P23250 407 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W GSP2P32836 220 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SOD1P00445 154 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
YRF1-2YER190W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W UPS3Q04006 179 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W DFG5Q05031 458 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W ERG2P32352 222 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W YPT10P38146 199 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W DPP1Q05521 289 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W YOR376WQ08900 122 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W ADH1P00330 348 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W RPS27BP38711 82 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W BNS1P50084 137 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-2YER190W YBL059WP34224 193 aa7.26□□□□□ -1.25
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