RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CDR1P51861 262 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPAQ15257 358 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM212AQ96EL1 285 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 LPIN3Q9BQK8 851 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 LACTBL1A8MY62 500 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 MCM2P49736 904 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 MGAT5BQ3V5L5 792 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 DTHD1Q6ZMT9 781 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 GAB3Q8WWW8 586 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 TASP1Q9H6P5 420 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC8A2Q9UPR5 921 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-217ENST00000629983 CITO14578 2027 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PPEF2O14830 753 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC25CP30307 473 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 LIG4P49917 911 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SENP8Q96LD8 212 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PLIN2Q99541 437 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 HAPLN2Q9GZV7 340 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 EPN2O95208 641 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMK1P53667 647 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB6Q15916 424 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A12Q504Y0 691 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PKN3Q6P5Z2 889 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 KBTBD6Q86V97 674 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 LOXL4Q96JB6 756 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YCG3 227 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 LAD1O00515 517 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF806P0C7X5 589 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TUFMP49411 452 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 KYAT1Q16773 422 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 GKN1Q9NS71 199 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 RXFP3Q9NSD7 469 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PMLP29590 882 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 LILRA4P59901 499 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 IL17AQ16552 155 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 STPG1Q5TH74 334 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 GIPC2Q8TF65 315 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SMOC1Q9H4F8 434 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG13O75143 517 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPHP41219 470 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10T2Q8NGX3 314 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 HSFX1Q9UBD0 423 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 OGTO15294 1046 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA1Q5VX52 437 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 JADE1Q6IE81 842 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFHX4Q86UP3 3567 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G4BP0C869 781 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF6P18850 670 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 WEE1P30291 646 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 AVPR1AP37288 418 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 RAP1GAPP47736 663 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 NCKAP1LP55160 1127 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 BFSP1Q12934 665 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 FSTL4Q6MZW2 842 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL23Q86XA0 190 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA5Q96PV4 448 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MSTO1Q9BUK6 570 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC46A2Q9BY10 475 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 IL21Q9HBE4 155 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MPLP40238 635 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 RUNX3Q13761 415 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf57Q5W0N0 161 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM68Q6AZZ1 485 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CMTM8Q8IZV2 173 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN18Q96SJ8 248 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 EBF3Q9H4W6 596 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 KCND2Q9NZV8 630 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 USP24Q9UPU5 2620 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ENM7 598 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF40O75150 1001 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 PAX3P23760 479 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM132DQ14C87 1099 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM196Q5HYL7 178 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 THEM5Q8N1Q8 247 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 HHIPQ96QV1 700 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 HPS4Q9NQG7 708 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 DSEQ9UL01 958 aa29.61■■■□□ 2.33
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