RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625299.1

PNKP-218, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 428 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-218ENST00000625299 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 TCEAL3Q969E4 200 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 BICD1Q96G01 975 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 RAB34Q9BZG1 259 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 TASP1Q9H6P5 420 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 OBP2AQ9NY56 170 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 ANK1P16157 1881 aa15.96■□□□□ 0.15
PNKP-218ENST00000625299 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TM4SF5O14894 197 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 ODC1P11926 461 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TNFSF9P41273 254 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 ST3GAL1Q11201 340 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 MYBPC2Q14324 1141 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PTPAQ15257 358 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TAF12Q16514 161 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 KRT79Q5XKE5 535 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 HHIPQ96QV1 700 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 STK24Q9Y6E0 443 aa15.95■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TSC2P49815 1807 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PPEF2O14830 753 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 ATG13O75143 517 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 RNF40O75150 1001 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CLTAP09496 248 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CDC25AP30304 524 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CDC25CP30307 473 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 SMTNP53814 917 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 MCL1Q07820 350 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PLA2G2CQ5R387 149 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 KCNK18Q7Z418 384 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 GIPC2Q8TF65 315 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 FAM212AQ96EL1 285 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 EBF3Q9H4W6 596 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 GKN1Q9NS71 199 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.94■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 LAMA1P25391 3075 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TTC26A0AVF1 554 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 LACTBL1A8MY62 500 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 EGFP01133 1207 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PROS1P07225 676 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 C1QTNF9P0C862 333 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PLS3P13797 630 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 ATF6P18850 670 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TYMPP19971 482 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CYP3A5P20815 502 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 NEK4P51957 841 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CREB5Q02930 508 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PDIA5Q14554 519 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 ZPBP2Q6X784 338 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CCDC83Q8IWF9 413 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 SENP8Q96LD8 212 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 EDEM2Q9BV94 578 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 HPS4Q9NQG7 708 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 VPS45Q9NRW7 570 aa15.93■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 AKAP3O75969 853 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 GUCY2CP25092 1073 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 AVPR1AP37288 418 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TRAPPC10P48553 1259 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 BFSP1Q12934 665 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 FOXC1Q12948 553 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 RUNX3Q13761 415 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 ZBTB6Q15916 424 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PLK5Q496M5 336 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TTC16Q8NEE8 873 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 PLIN2Q99541 437 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 TIPINQ9BVW5 301 aa15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PNKP-218ENST00000625299 IL21Q9HBE4 155 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms