RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 LHX5Q9H2C1 402 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 AMFRQ9UKV5 643 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MTA2O94776 668 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP1A2P05177 515 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.442e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIK3Q13003 919 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC181Q5TID7 509 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NAA35Q5VZE5 725 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GLB1LQ6UWU2 654 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PEX26Q7Z412 305 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TOX2Q96NM4 488 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF39Q9H2S5 420 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SMYD3Q9H7B4 428 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX12Q9UMY4 172 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CES2O00748 559 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXA2O43364 376 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ABL1P00519 1130 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 UQCRHP07919 91 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MLH1P40692 756 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GUCY2FP51841 1108 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF394Q53GI3 561 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF169Q8NCN4 708 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA18Q8TC71 538 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TNIP3Q96KP6 325 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP290O15078 2479 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL5CA6NH57 179 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD23BP54727 409 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NOMO3P69849 1222 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MTFR1Q15390 333 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CNGA2Q16280 664 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ARMC5Q96C12 935 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GAD1Q99259 594 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PARVAQ9NVD7 372 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 HESX1Q9UBX0 185 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAGE8P0CG41 777 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 RAP1GAPP47736 663 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NDST1P52848 882 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC8A3P57103 927 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ERICH1Q86X53 443 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PBKQ96KB5 322 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PLVAPQ9BX97 442 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 A8MXQ7 604 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SETSIPP0DME0 302 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 DESP17661 470 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CDH8P55286 799 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF333Q96JL9 665 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP85Q9BW27 656 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNCQ9H7C4 482 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ACP6Q9NPH0 428 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 DSEQ9UL01 958 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PODXLO00592 558 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 DYNC1I1O14576 645 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ENC1O14682 589 aa24.02■■□□□ 1.44
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