RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 PAAF1Q9BRP4 392 aa27.74■■■□□ 2.03
SCAMP4-210ENST00000588555 MCOLN1Q9GZU1 580 aa27.74■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 ORC1Q13415 861 aa27.73■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 C3orf58Q8NDZ4 430 aa27.73■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 L1RE1Q9UN81 338 aa27.73■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
SCAMP4-210ENST00000588555 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 NOMO2Q5JPE7 1267 aa27.71■■■□□ 2.03
SCAMP4-210ENST00000588555 DPH6Q7L8W6 267 aa27.71■■■□□ 2.03
SCAMP4-210ENST00000588555 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.71■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 NOX5Q96PH1 765 aa27.71■■■□□ 2.03
SCAMP4-210ENST00000588555 PDCL3Q9H2J4 239 aa27.71■■■□□ 2.03
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SCAMP4-210ENST00000588555 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
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SCAMP4-210ENST00000588555 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.7■■■□□ 2.02
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SCAMP4-210ENST00000588555 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
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SCAMP4-210ENST00000588555 GTF3C4Q9UKN8 822 aa27.67■■■□□ 2.02
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
SCAMP4-210ENST00000588555 HCRTO43612 131 aa27.66■■■□□ 2.02
SCAMP4-210ENST00000588555 TIMP1P01033 207 aa27.66■■■□□ 2.02
SCAMP4-210ENST00000588555 NSFP46459 744 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SCAMP4-210ENST00000588555 SGO2Q562F6 1265 aa27.66■■■□□ 2.02
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