RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 NUP43Q8NFH3 380 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.06□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ARMT1Q9H993 441 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 GP6Q9HCN6 339 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 TMEM260Q9NX78 707 aa5.06□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PTPN13Q12923 2485 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PATJQ8NI35 1801 aa5.06□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ZNF532Q9HCE3 1301 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 TBC1D4O60343 1298 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 KRT38O76015 456 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ZNF205O95201 554 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 CAPNS1P04632 268 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ITGA4P13612 1032 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 EPCAMP16422 314 aa5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 CD247P20963 164 aa5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 CALML3P27482 149 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PBX3P40426 434 aa5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 TCEAL1Q15170 157 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 C12orf60Q5U649 245 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 IL31Q6EBC2 164 aa5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 SCFD2Q8WU76 684 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 TBC1D5Q92609 795 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 ATP6V0A1Q93050 837 aa5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 TCF25Q9BQ70 676 aa5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 TELO2Q9Y4R8 837 aa5.05□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.05□□□□□ -1.6
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CNN3-204ENST00000461018 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 A0A1W2PQJ5 194 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 NUDT19A8MXV4 375 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 F2P00734 622 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 GH1P01241 217 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 CD3EP07766 207 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 TDGF1P13385 188 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PLA2G2AP14555 144 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 PNLIPP16233 465 aa5.04□□□□□ -1.6
CNN3-204ENST00000461018 GNAT2P19087 354 aa5.04□□□□□ -1.6
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