RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 DPP7Q9UHL4 492 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CDH7Q9ULB5 785 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CACNA1AO00555 2505 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 BTBD18B2RXH4 712 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 RECQL4O94761 1208 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 C8AP07357 584 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CD72P21854 359 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 RFX1P22670 979 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 KRT2P35908 639 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CD97P48960 835 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 VAC14Q08AM6 782 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ST3GAL1Q11201 340 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PSMD5Q16401 504 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FAM187BQ17R55 369 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PATJQ8NI35 1801 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF292O60281 2723 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 I3L4J1 428 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 JAK2O60674 1132 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CDKL5O76039 1030 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 OR1D2P34982 312 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CREMQ03060 361 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 FZD5Q13467 585 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 RAB33AQ14088 237 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ECM1Q16610 540 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ME3Q16798 604 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 HACE1Q8IYU2 909 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 ING5Q8WYH8 240 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 KXD1Q9BQD3 176 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.21□□□□□ -1.25
HOXD8-202ENST00000429017 NEMFO60524 1076 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 PRKCBP05771 671 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 THP07101 528 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 XBP1P17861 261 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 HOXA9P31269 272 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 BRCC3P46736 316 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 TSSK4Q6SA08 328 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 CEP120Q8N960 986 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT8Q8WV74 236 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 MTRRQ9UBK8 725 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 POLIQ9UNA4 740 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 GDAQ9Y2T3 454 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 FAM170BA6NMN3 283 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 ACKR2O00590 384 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 NCANO14594 1321 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 N4BP3O15049 544 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 RHOP08100 348 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 COL4A2P08572 1712 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 POU2F2P09086 479 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 CEBPBP17676 345 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 LIG1P18858 919 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 CYP11B2P19099 503 aa7.2□□□□□ -1.26
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