RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 WEE1P30291 646 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 LRPAP1P30533 357 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 MCM2P49736 904 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ACAP1Q15027 740 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF174Q15697 407 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ME3Q16798 604 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 GATA6Q92908 595 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 GKN1Q9NS71 199 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 CCL26Q9Y258 94 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ASB3Q9Y575 518 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 LAMA5O15230 3695 aa14.68□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 LNP1A1A4G5 178 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC16A4O15374 487 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 CAVIN2O95810 425 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ATF6P18850 670 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 CREB5Q02930 508 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ZBTB6Q15916 424 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 GTF3C6Q969F1 213 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 EBF3Q9H4W6 596 aa14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 SFI1A8K8P3 1242 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 E9PMD0 336 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ATG13O75143 517 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 TOM1L1O75674 476 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ARSAP15289 507 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 GUCY1B3Q02153 619 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 RUNX3Q13761 415 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 MYBPC2Q14324 1141 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.065e-13■■■■□ 24.2
CHCHD2-201ENST00000395422 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 USP37Q86T82 979 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF12Q96FN5 646 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.66□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 TTC26A0AVF1 554 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 FGF19O95750 216 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 TYMPP19971 482 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 TNFSF9P41273 254 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 GALK1P51570 392 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 MCL1Q07820 350 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ST3GAL1Q11201 340 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 NBR1Q14596 966 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 ITIH5Q86UX2 942 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 GIPC2Q8TF65 315 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 INVSQ9Y283 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHCHD2-201ENST00000395422 AKAP13Q12802 2813 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 PATE3B3GLJ2 98 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 CYP3A5P20815 502 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 CDC25CP30307 473 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 RING1Q06587 406 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 TRIM29Q14134 588 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 PTPAQ15257 358 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 ELF2Q15723 593 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 KCNK18Q7Z418 384 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.64□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.63□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 PP2D1A8MPX8 630 aa14.63□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 LACTBL1A8MY62 500 aa14.63□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 RHOBTB1O94844 696 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms