RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372146.4

GTF3C4-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C4, Length 9,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-201ENST00000372146 PRIM2P49643 509 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 CDH6P55285 790 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 EPS8Q12929 822 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 LRRC6Q86X45 466 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 FRMD6Q96NE9 622 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 COMMD9Q9P000 198 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PBRM1Q86U86 1689 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 AKAP14Q86UN6 197 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PACS2Q86VP3 889 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 UTYO14607 1347 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 CHRNB3Q05901 458 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 RBBP4Q09028 425 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ING4Q9UNL4 249 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 MEI4A8MW99 385 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 SCGNO76038 276 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ATP4AP20648 1035 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ATL2Q8NHH9 583 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ZIM3Q96PE6 472 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 GPR1P46091 355 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 HSF2Q03933 536 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 KCNH2Q12809 1159 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 RORBQ92753 470 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 SNX12Q9UMY4 172 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ZNF682O95780 498 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ATP6V1C1P21283 382 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC9A7Q96T83 725 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 LRCH1Q9Y2L9 728 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ACCSLQ4AC99 568 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 RUNDC3AQ59EK9 446 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PIF1Q9H611 641 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 HPS1Q92902 700 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 GNPATO15228 680 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 FOPNLQ96NB1 174 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 GDAQ9Y2T3 454 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 MAGEB18Q96M61 343 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 HEY2Q9UBP5 337 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 MLXQ9UH92 298 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 C2CD2Q9Y426 696 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ATP10BO94823 1461 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 NR3C1P04150 777 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ABCC4O15439 1325 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PRCPP42785 496 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 NUP160Q12769 1436 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 CDC25CP30307 473 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ICA1Q05084 483 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 KCNB1Q14721 858 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 JADE3Q92613 823 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PHTF1Q9UMS5 762 aa15.92■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 EFHC2Q5JST6 749 aa15.91■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.91■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15.91■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GTF3C4-201ENST00000372146 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms