RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GKN1Q9NS71 199 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 OPHN1O60890 802 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 OAZ2O95190 189 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MCF2P10911 925 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP11B2P19099 503 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MUTP22033 750 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT2P35908 639 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 EVCP57679 992 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TNK2Q07912 1038 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 XKR4Q5GH76 650 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PADI6Q6TGC4 694 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TMC8Q8IU68 726 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT12Q8IV01 421 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CD101Q93033 1021 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTN3Q9P232 1028 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 STK24Q9Y6E0 443 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC169A6NNP5 214 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 M0QZQ0 153 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF10BO14763 440 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC45O75419 566 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 EGFP01133 1207 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SYPP08247 313 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ODC1P11926 461 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TYMPP19971 482 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA4P34932 840 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK8P45983 427 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNAR2P48551 515 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 OSTNP61366 133 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 IRX4P78413 519 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 STRN3Q13033 797 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KYAT1Q16773 422 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPPQ6IPU0 288 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL23Q86XA0 190 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2A3Q93084 1043 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF2CQ99661 725 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC3Q9BY71 257 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 EBF3Q9H4W6 596 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TDP1Q9NUW8 608 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KLK13Q9UKR3 277 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DSEQ9UL01 958 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 STK36Q9NRP7 1315 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DCLK1O15075 740 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 REC8O95072 547 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CPA1P15085 419 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ENGP17813 658 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP3A5P20815 502 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 29.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE6CP51160 858 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 GALK1P51570 392 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM29Q14134 588 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR44Q5JSH3 913 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-201ENST00000296642 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.55□□□□□ -1.04
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