RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 EBAG9O00559 213 aa25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CCNG2Q16589 344 aa25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 DCUN1D2Q6PH85 259 aa25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CROCCP2Q86T23 111 aa25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC25Q86WR0 208 aa25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PGM2Q96G03 612 aa25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 GPR25O00155 361 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 NFICP08651 508 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 MCF2P10911 925 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ATF2P15336 505 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ADORA2AP29274 412 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TNFAIP2Q03169 654 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ERICH1Q86X53 443 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PPTC7Q8NI37 304 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 SIX4Q9UIU6 781 aa25.38■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TP73O15350 636 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 MAGEB2O15479 319 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TMOD1P28289 359 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ADCY2Q08462 1091 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 LINC01465Q8N7H1 131 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 BCO2Q9BYV7 579 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL11Q9NVR0 708 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TULP2O00295 520 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 KRT1P04264 644 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 COL1A2P08123 1366 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 STAG3L1P0CL83 205 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 IVDP26440 423 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 RAP1GAPP47736 663 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC38Q5VT99 294 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 C3orf20Q8ND61 904 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 SCLT1Q96NL6 688 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 AKT3Q9Y243 479 aa25.37■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 A0A087WZ62 844 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 MED7O43513 233 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CD19P15391 556 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TCF4P15884 667 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CAV1Q03135 178 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 AMHR2Q16671 573 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 SLITRK1Q96PX8 696 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 LACTBL1A8MY62 500 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 MYO1CO00159 1063 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF286BP0CG31 522 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CDR1P51861 262 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 OGDHQ02218 1023 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 JADE1Q6IE81 842 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 DENND1BQ6P3S1 775 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 AFG1LQ8WV93 481 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 SYT17Q9BSW7 474 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 NEU2Q9Y3R4 380 aa25.36■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ITGA8P53708 1063 aa25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 WDR72Q3MJ13 1102 aa25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF365Q70YC5 407 aa25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 NLRP14Q86W24 1093 aa25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 FAM118BQ9BPY3 351 aa25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 AAASQ9NRG9 546 aa25.35■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 TLDC2A0PJX2 215 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 SMIM23A6NLE4 172 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 F8VP50 259 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PDHXO00330 501 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 PAEPP09466 180 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ADCY8P40145 1251 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.34■■□□□ 1.65
TRIM54-201ENST00000296098 NIPA2Q8N8Q9 360 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms