RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 KRT71Q3SY84 523 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 JADE1Q6IE81 842 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CPB2Q96IY4 423 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 MCEEQ96PE7 176 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CEP83Q9Y592 693 aa20.89■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 TMOD1P28289 359 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 WHRNQ9P202 907 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CITO14578 2027 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 H3BRB1 525 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 TP73O15350 636 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ZEB2O60315 1214 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 GJC1P36383 396 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CALCOCO2Q13137 446 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 PTK6Q13882 451 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 DENND2CQ68D51 928 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ERICH1Q86X53 443 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CXorf38Q8TB03 319 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.88■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SHBGP04278 402 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ITGB3P05106 788 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 TCF4P15884 667 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 GUCY1A3Q02108 690 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 OGDHQ02218 1023 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SLMAPQ14BN4 828 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 C3orf20Q8ND61 904 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SDCBP2Q9H190 292 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ASB7Q9H672 318 aa20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CDH8P55286 799 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 TAP1Q03518 808 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 GPR142Q7Z601 462 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ATL2Q8NHH9 583 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 GAS8O95995 478 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 RARGP13631 454 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CD19P15391 556 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 RAD23BP54727 409 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 GRB14Q14449 540 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SLC29A2Q14542 456 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CCNG2Q16589 344 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 DPP9Q86TI2 863 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 HOOK3Q86VS8 718 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 MAML3Q96JK9 1138 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 LHX5Q9H2C1 402 aa20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 F8VP50 259 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 MED7O43513 233 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 PAEPP09466 180 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SMPD1P17405 629 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 IVDP26440 423 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 LSP1P33241 339 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 LRRC38Q5VT99 294 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 NLRP7Q8WX94 980 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 CCDC114Q96M63 670 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 TSPAN1O60635 241 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 ITIH2P19823 946 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 GRIK4Q16099 956 aa20.85■□□□□ 0.93
RTKN-201ENST00000233330 KYAT1Q16773 422 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms