RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055562.2

Hoxc12-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc12, Length 1,031 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Spg21Q9CQC8 308 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 TheglQ9DA15 459 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Egfl6Q9JJZ5 550 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gde1Q9JL56 331 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Irs2P81122 1321 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Znf568E9PYI1 671 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Olfr552E9Q545 317 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rdh7O88451 316 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Actn3O88990 900 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tpp1O89023 562 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pkn1P70268 946 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Prdx5P99029 210 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Atg9bQ6EBV9 922 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Q6GQV0 436 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Oxsr1Q6P9R2 527 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Necab1Q8BG18 352 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Brat1Q8C3R1 822 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ftsj1Q8CBC7 324 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cdk17Q8K0D0 523 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tada3Q8R0L9 432 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Zdhhc3Q8R173 299 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Noxred1Q9D3S5 366 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rab11fip1Q9D620 645 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 MesdQ9ERE7 224 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gadd45gQ9Z111 159 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Col4a6B1AVK5 1691 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Scn1aA2APX8 2009 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cnbd1B1AWM0 430 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 AU015836B2RUM3 263 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Lmod3E9QA62 571 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Dcpp3L7N259 170 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Smpd2O70572 419 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 DtnbO70585 659 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cyp21P03940 487 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Mkl2P59759 1080 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 March5Q3KNM2 278 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 PrcpQ7TMR0 491 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Depdc1bQ8BH88 529 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Amz1Q8BVF9 502 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Kat5Q8CHK4 513 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Asic2Q925H0 512 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cacng4Q9JJV4 327 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cyp2b13A6H6J2 491 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gm4846B2RWH8 538 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Vmn2r19G5E8G4 854 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Fermt1P59113 677 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Sh3bp2Q06649 559 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Dmc1Q61880 340 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ano6Q6P9J9 911 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tas2r134Q7TQB0 298 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rd3Q8BRE0 195 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 GancQ8BVW0 898 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tmem161aQ8VCA6 480 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tnni1Q9WUZ5 187 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Plxna1P70206 1894 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 9330159F19RikD3Z623 648 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 P01650 108 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 P01653 108 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 PrphP15331 475 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Brcc3P46737 291 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Shmt1P50431 478 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Grm2Q14BI2 872 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 PostnQ62009 838 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tas2r125Q7M710 311 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Olfr412Q7TRW7 312 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Epn1Q80VP1 575 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Maip1Q8BHE8 291 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Usp1Q8BJQ2 784 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Dnm3Q8BZ98 863 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Lrrc45Q8CIM1 670 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pcdhb19Q91Y01 801 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Mfsd5Q921Y4 450 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tpgs1Q99MS8 303 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gm27029A2A4P4 543 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Oaz2O08608 189 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 PargO88622 969 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 mt-Co3P00416 261 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Oas1aP11928 367 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 YwhahP68510 246 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cdh8P97291 799 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Sox8Q04886 464 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Lrch2Q3UMG5 773 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Grm6Q5NCH9 871 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms