RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SbdsP70122 250 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 C2cd2lQ80X80 706 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AspgA0JNU3 564 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim43bP86448 445 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam81aQ3UXZ6 364 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 OgtQ8CGY8 1046 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps72Q62481 368 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpr151Q7TSN6 422 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxp3Q99JB6 429 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgfr1op2Q9CRA9 253 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B4galt5Q9JMK0 388 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cpsf3Q9QXK7 684 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 JrklB2RRL2 523 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp4f40G3UW81 524 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hoxc6P10629 235 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cav1P49817 178 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ephb2P54763 986 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d1Q60949 1255 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ablim1Q8K4G5 861 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr395Q8VGR3 312 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmod4Q9JLH8 345 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sgk1Q9WVC6 431 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efna5O08543 228 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Art2bO35975 289 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rasgrf1P27671 1262 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gad2P48320 585 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ripk2P58801 539 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde1bQ01065 535 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam83hQ148V8 1209 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GsapQ3TCV3 858 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd180Q62192 661 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubap1Q8BH48 502 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q8CD60 292 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 VcpQ01853 806 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lipo3Q3UT41 399 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam214aQ69ZK7 1075 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Anxa9Q9JHQ0 345 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbp3P49194 1234 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ndufs6P52503 116 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CpQ61147 1061 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf12Q7TSI0 686 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ap3m2Q8R2R9 418 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc6D3YZP9 469 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DffaO54786 331 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt13P08730 437 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdh8P97291 799 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan2Q07230 614 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trappc3lQ4KL14 181 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmx4Q8C0L0 335 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 OafQ8QZR4 282 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mfsd5Q921Y4 450 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 St13Q99L47 371 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dusp21Q9D9D8 189 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q9DA42 136 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Irx5Q9JKQ4 484 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ass1P16460 412 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dpysl3Q62188 570 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc50Q810U5 305 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Syt15Q8C6N3 418 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp449Q8CB76 518 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cog3Q8CI04 820 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MgarpQ8VI64 283 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lonrf2B2RT44 518 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 March4Q80TE3 409 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mical2Q8BML1 960 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plod3Q9R0E1 741 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Capn6O35646 641 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cetn1P41209 172 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Irf3P70671 419 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbxl13Q8CDU4 790 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lamtor4Q8CF66 99 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Golga1Q9CW79 758 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clec4aQ9QZ15 238 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tspyl1O88852 379 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rab20P35295 233 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HpseQ6YGZ1 535 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Moxd2Q7TT41 619 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map4k3Q99JP0 894 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp11Q99K46 921 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubb1A2AQ07 451 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Drg1P32233 367 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.8 ms