RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	ERV1	P27882	189 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	NUD1	P32336	851 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YIL029C	P40538	142 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YGL204C	P53089	101 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	SDS23	P53172	527 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	MKC7	P53379	596 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	WTM2	Q12206	467 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	TIR1	P10863	254 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	CPT1	P17898	393 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	FRM2	P37261	193 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	UME6	P39001	836 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	KEG1	P43614	200 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YJR096W	P47137	282 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	NIS1	P53939	407 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	AGE1	Q04412	482 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	IRC25	Q07951	179 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	CTA1	P15202	515 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YBR184W	P38299	523 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	MIC27	P50945	234 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YIP5	P53108	310 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	SUR7	P54003	302 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	PIN3	Q06449	215 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	ATG5	Q12380	294 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	BOL1	Q3E793	110 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	HMRA1	P0CY11	126 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RNQ1	P25367	405 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YEF1	P32622	495 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YUH1	P35127	236 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	SDH4	P37298	181 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	DFG10	P40526	253 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	AZF1	P41696	914 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	YML096W	Q04489	525 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RAF1	Q06891	181 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	MCP1	Q12106	302 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RPO31	YOR116C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YJU3	P28321	313 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SRP21	P32342	167 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DER1	P38307	211 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YMR253C	Q04835	414 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MRL1	Q06815	381 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	THI2	P38141	450 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YNL165W	P53891	406 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MRX11	Q03079	207 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YOR186W	Q08560	144 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPL162C	Q12042	273 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	AVT5	P38176	459 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.39	□□□□□ -1.87	not detected
RPO31	YOR116C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YJR115W	P47152	169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	SEN15	Q04675	128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	BSC6	Q08280	497 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RKI1	Q12189	258 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ORT1	Q12375	292 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	DGK1	Q12382	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	UBR1	P19812	1950 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	GCS1	P35197	352 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YKR073C	P36153	106 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YPS6	P40583	537 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	BUD8	P41698	603 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	RNH201	P53942	307 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	YDL242W	Q07746	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	COQ10	Q08058	207 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	NDD1	Q08887	554 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	PAU16	P35994	123 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPO31	YOR116C	GEP4	P38812	185 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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