RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	MCH2	P36032	473 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	MIA40	P36046	403 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YBR013C	P38215	129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	SHG1	P38337	142 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	FLX1	P40464	311 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	TAX4	P47030	604 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	ATG5	Q12380	294 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	ATG15	P25641	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	ERV1	P27882	189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	IMP1	P28627	190 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	CLB6	P32943	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	SDH4	P37298	181 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	SLM6	P38343	150 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	DAN1	P47178	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	TIM21	P53220	239 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YNR066C	P53752	436 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	FSH2	Q05015	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YPD1	Q07688	167 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	PRR2	Q12310	699 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	DGK1	Q12382	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	SPO13	P23624	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	POF1	P25576	258 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	UPS2	P35200	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YBR096W	P38256	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YIL029C	P40538	142 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	BNS1	P50084	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	AGC1	Q12482	902 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	ATG40	Q99325	256 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	CDC50	P25656	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YUH1	P35127	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	MRPL4	P36517	319 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YBR292C	P38357	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	CUE1	P38428	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YER084W	P40057	128 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	XPT1	P47165	209 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YGL262W	P53054	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	FYV6	P53913	173 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RCE1	Q03530	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RIM9	Q04734	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	PIN3	Q06449	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YFH1	Q07540	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	FIT3	Q08907	204 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	FCY22	Q12119	530 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	AHT1	P29589	182 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	HOT13	P36078	116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	MRPL39	P36533	70 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	ICS2	P38284	255 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	SEN34	P39707	275 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	PCL7	P40186	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RTS2	P40962	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	ATG27	P46989	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	GEP7	P53171	287 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RAF1	Q06891	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	RNH203	Q12338	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRS33	YOR115C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	POP5	P28005	173 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YGR269W	P40326	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PHB1	P40961	287 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	ERG25	P53045	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YGL114W	P53134	725 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	WSC2	P53832	503 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PDR17	P53844	350 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	ARL3	Q02804	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	ECM18	Q04623	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	CTR3	Q06686	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	PAM18	Q07914	168 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	FCY2	P17064	533 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	SEC59	P20048	519 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TRS33	YOR115C	MRPS9	P38120	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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